Protein–RNA interactions for Protein: Q52KF3

Spire1, Protein spire homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spire1Q52KF3 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Spire1Q52KF3 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Spire1Q52KF3 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Spire1Q52KF3 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Spire1Q52KF3 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Spire1Q52KF3 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Spire1Q52KF3 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Spire1Q52KF3 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Spire1Q52KF3 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Spire1Q52KF3 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Spire1Q52KF3 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Spire1Q52KF3 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Spire1Q52KF3 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Spire1Q52KF3 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Spire1Q52KF3 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Spire1Q52KF3 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Spire1Q52KF3 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Spire1Q52KF3 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Spire1Q52KF3 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Spire1Q52KF3 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Spire1Q52KF3 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Spire1Q52KF3 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Spire1Q52KF3 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Spire1Q52KF3 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Spire1Q52KF3 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Spire1Q52KF3 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Spire1Q52KF3 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Spire1Q52KF3 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Spire1Q52KF3 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Spire1Q52KF3 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Spire1Q52KF3 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Spire1Q52KF3 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Spire1Q52KF3 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Spire1Q52KF3 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Spire1Q52KF3 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Spire1Q52KF3 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Spire1Q52KF3 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Spire1Q52KF3 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Spire1Q52KF3 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Spire1Q52KF3 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Spire1Q52KF3 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Spire1Q52KF3 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Spire1Q52KF3 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Spire1Q52KF3 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Spire1Q52KF3 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Spire1Q52KF3 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Spire1Q52KF3 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Spire1Q52KF3 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Spire1Q52KF3 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Spire1Q52KF3 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Spire1Q52KF3 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Spire1Q52KF3 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Spire1Q52KF3 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Spire1Q52KF3 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Spire1Q52KF3 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Spire1Q52KF3 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Spire1Q52KF3 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Spire1Q52KF3 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Spire1Q52KF3 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Spire1Q52KF3 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Spire1Q52KF3 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Spire1Q52KF3 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Spire1Q52KF3 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Spire1Q52KF3 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Spire1Q52KF3 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Spire1Q52KF3 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Spire1Q52KF3 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Spire1Q52KF3 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Spire1Q52KF3 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Spire1Q52KF3 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Spire1Q52KF3 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Spire1Q52KF3 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Spire1Q52KF3 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Spire1Q52KF3 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Spire1Q52KF3 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Spire1Q52KF3 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Spire1Q52KF3 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Spire1Q52KF3 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Spire1Q52KF3 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Spire1Q52KF3 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Spire1Q52KF3 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Spire1Q52KF3 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Spire1Q52KF3 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Spire1Q52KF3 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Spire1Q52KF3 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Spire1Q52KF3 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Spire1Q52KF3 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Spire1Q52KF3 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Spire1Q52KF3 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Spire1Q52KF3 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Spire1Q52KF3 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Spire1Q52KF3 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Spire1Q52KF3 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Spire1Q52KF3 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Spire1Q52KF3 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Spire1Q52KF3 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Spire1Q52KF3 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Spire1Q52KF3 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Spire1Q52KF3 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Spire1Q52KF3 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms