Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZJM7

Otol1, Otolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otol1Q4ZJM7 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Otol1Q4ZJM7 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Otol1Q4ZJM7 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Otol1Q4ZJM7 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Otol1Q4ZJM7 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Otol1Q4ZJM7 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Otol1Q4ZJM7 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Otol1Q4ZJM7 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Otol1Q4ZJM7 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Otol1Q4ZJM7 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Otol1Q4ZJM7 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Otol1Q4ZJM7 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Otol1Q4ZJM7 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Otol1Q4ZJM7 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Otol1Q4ZJM7 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Otol1Q4ZJM7 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Otol1Q4ZJM7 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Otol1Q4ZJM7 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Otol1Q4ZJM7 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Otol1Q4ZJM7 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Otol1Q4ZJM7 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Otol1Q4ZJM7 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Otol1Q4ZJM7 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Otol1Q4ZJM7 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Otol1Q4ZJM7 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Otol1Q4ZJM7 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Otol1Q4ZJM7 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Otol1Q4ZJM7 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Otol1Q4ZJM7 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Otol1Q4ZJM7 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Otol1Q4ZJM7 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Otol1Q4ZJM7 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Otol1Q4ZJM7 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Otol1Q4ZJM7 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Otol1Q4ZJM7 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Otol1Q4ZJM7 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Otol1Q4ZJM7 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Otol1Q4ZJM7 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Otol1Q4ZJM7 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Otol1Q4ZJM7 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Otol1Q4ZJM7 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Otol1Q4ZJM7 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Otol1Q4ZJM7 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Otol1Q4ZJM7 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Otol1Q4ZJM7 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Otol1Q4ZJM7 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Otol1Q4ZJM7 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Otol1Q4ZJM7 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Otol1Q4ZJM7 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Otol1Q4ZJM7 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Otol1Q4ZJM7 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Otol1Q4ZJM7 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Otol1Q4ZJM7 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Otol1Q4ZJM7 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Otol1Q4ZJM7 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Otol1Q4ZJM7 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Otol1Q4ZJM7 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Otol1Q4ZJM7 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Otol1Q4ZJM7 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Otol1Q4ZJM7 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Otol1Q4ZJM7 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Otol1Q4ZJM7 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Otol1Q4ZJM7 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Otol1Q4ZJM7 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Otol1Q4ZJM7 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Otol1Q4ZJM7 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Otol1Q4ZJM7 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Otol1Q4ZJM7 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Otol1Q4ZJM7 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Otol1Q4ZJM7 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Otol1Q4ZJM7 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Otol1Q4ZJM7 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Otol1Q4ZJM7 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Otol1Q4ZJM7 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Otol1Q4ZJM7 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Otol1Q4ZJM7 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Otol1Q4ZJM7 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Otol1Q4ZJM7 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Otol1Q4ZJM7 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Otol1Q4ZJM7 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Otol1Q4ZJM7 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Otol1Q4ZJM7 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Otol1Q4ZJM7 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Otol1Q4ZJM7 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Otol1Q4ZJM7 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Otol1Q4ZJM7 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Otol1Q4ZJM7 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Otol1Q4ZJM7 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Otol1Q4ZJM7 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Otol1Q4ZJM7 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Otol1Q4ZJM7 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Otol1Q4ZJM7 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Otol1Q4ZJM7 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Otol1Q4ZJM7 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Otol1Q4ZJM7 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Otol1Q4ZJM7 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Otol1Q4ZJM7 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Otol1Q4ZJM7 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Otol1Q4ZJM7 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Otol1Q4ZJM7 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms