Protein–RNA interactions for Protein: Q4VAA7

Snx33, Sorting nexin-33, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx33Q4VAA7 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx33Q4VAA7 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx33Q4VAA7 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx33Q4VAA7 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx33Q4VAA7 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx33Q4VAA7 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx33Q4VAA7 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx33Q4VAA7 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx33Q4VAA7 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx33Q4VAA7 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx33Q4VAA7 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx33Q4VAA7 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx33Q4VAA7 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx33Q4VAA7 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx33Q4VAA7 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx33Q4VAA7 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx33Q4VAA7 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx33Q4VAA7 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx33Q4VAA7 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx33Q4VAA7 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx33Q4VAA7 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx33Q4VAA7 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
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Snx33Q4VAA7 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx33Q4VAA7 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Snx33Q4VAA7 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Snx33Q4VAA7 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx33Q4VAA7 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Snx33Q4VAA7 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Snx33Q4VAA7 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Snx33Q4VAA7 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx33Q4VAA7 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx33Q4VAA7 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Snx33Q4VAA7 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx33Q4VAA7 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx33Q4VAA7 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Snx33Q4VAA7 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx33Q4VAA7 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx33Q4VAA7 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx33Q4VAA7 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx33Q4VAA7 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Snx33Q4VAA7 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Snx33Q4VAA7 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Snx33Q4VAA7 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx33Q4VAA7 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx33Q4VAA7 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx33Q4VAA7 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx33Q4VAA7 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx33Q4VAA7 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Snx33Q4VAA7 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Snx33Q4VAA7 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Snx33Q4VAA7 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Snx33Q4VAA7 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Snx33Q4VAA7 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Snx33Q4VAA7 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Snx33Q4VAA7 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx33Q4VAA7 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx33Q4VAA7 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx33Q4VAA7 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx33Q4VAA7 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Snx33Q4VAA7 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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