Protein–RNA interactions for Protein: Q4U2R1

Herc2, E3 ubiquitin-protein ligase HERC2, mousemouse

Predictions only

Length 4,836 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc2Q4U2R1 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Herc2Q4U2R1 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Herc2Q4U2R1 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Herc2Q4U2R1 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Herc2Q4U2R1 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Herc2Q4U2R1 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Herc2Q4U2R1 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Herc2Q4U2R1 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Herc2Q4U2R1 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Herc2Q4U2R1 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Herc2Q4U2R1 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Herc2Q4U2R1 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Herc2Q4U2R1 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Herc2Q4U2R1 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Herc2Q4U2R1 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Herc2Q4U2R1 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Herc2Q4U2R1 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Herc2Q4U2R1 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Herc2Q4U2R1 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Herc2Q4U2R1 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Herc2Q4U2R1 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Herc2Q4U2R1 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Herc2Q4U2R1 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Herc2Q4U2R1 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Herc2Q4U2R1 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Herc2Q4U2R1 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Herc2Q4U2R1 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Herc2Q4U2R1 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Herc2Q4U2R1 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Herc2Q4U2R1 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Herc2Q4U2R1 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Herc2Q4U2R1 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Herc2Q4U2R1 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Herc2Q4U2R1 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Herc2Q4U2R1 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Herc2Q4U2R1 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Herc2Q4U2R1 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Herc2Q4U2R1 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Herc2Q4U2R1 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Herc2Q4U2R1 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Herc2Q4U2R1 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Herc2Q4U2R1 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Herc2Q4U2R1 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Herc2Q4U2R1 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Herc2Q4U2R1 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Herc2Q4U2R1 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Herc2Q4U2R1 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Herc2Q4U2R1 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Herc2Q4U2R1 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Herc2Q4U2R1 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Herc2Q4U2R1 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Herc2Q4U2R1 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Herc2Q4U2R1 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Herc2Q4U2R1 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Herc2Q4U2R1 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Herc2Q4U2R1 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Herc2Q4U2R1 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Herc2Q4U2R1 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Herc2Q4U2R1 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Herc2Q4U2R1 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Herc2Q4U2R1 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Herc2Q4U2R1 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Herc2Q4U2R1 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Herc2Q4U2R1 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Herc2Q4U2R1 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Herc2Q4U2R1 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Herc2Q4U2R1 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Herc2Q4U2R1 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Herc2Q4U2R1 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Herc2Q4U2R1 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Herc2Q4U2R1 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Herc2Q4U2R1 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Herc2Q4U2R1 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Herc2Q4U2R1 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Herc2Q4U2R1 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Herc2Q4U2R1 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Herc2Q4U2R1 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Herc2Q4U2R1 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Herc2Q4U2R1 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Herc2Q4U2R1 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Herc2Q4U2R1 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Herc2Q4U2R1 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Herc2Q4U2R1 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Herc2Q4U2R1 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Herc2Q4U2R1 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Herc2Q4U2R1 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Herc2Q4U2R1 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Herc2Q4U2R1 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Herc2Q4U2R1 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Herc2Q4U2R1 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Herc2Q4U2R1 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Herc2Q4U2R1 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Herc2Q4U2R1 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Herc2Q4U2R1 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Herc2Q4U2R1 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Herc2Q4U2R1 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Herc2Q4U2R1 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Herc2Q4U2R1 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Herc2Q4U2R1 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Herc2Q4U2R1 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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