Protein–RNA interactions for Protein: Q499E0

Brinp3, BMP/retinoic acid-inducible neural-specific protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brinp3Q499E0 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Brinp3Q499E0 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Brinp3Q499E0 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Brinp3Q499E0 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Brinp3Q499E0 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Brinp3Q499E0 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Brinp3Q499E0 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Brinp3Q499E0 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Brinp3Q499E0 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Brinp3Q499E0 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Brinp3Q499E0 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Brinp3Q499E0 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Brinp3Q499E0 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Brinp3Q499E0 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Brinp3Q499E0 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Brinp3Q499E0 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Brinp3Q499E0 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Brinp3Q499E0 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Brinp3Q499E0 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Brinp3Q499E0 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Brinp3Q499E0 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Brinp3Q499E0 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Brinp3Q499E0 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Brinp3Q499E0 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Brinp3Q499E0 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Brinp3Q499E0 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Brinp3Q499E0 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Brinp3Q499E0 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Brinp3Q499E0 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Brinp3Q499E0 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Brinp3Q499E0 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Brinp3Q499E0 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Brinp3Q499E0 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Brinp3Q499E0 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Brinp3Q499E0 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Brinp3Q499E0 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Brinp3Q499E0 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Brinp3Q499E0 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Brinp3Q499E0 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Brinp3Q499E0 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Brinp3Q499E0 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Brinp3Q499E0 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Brinp3Q499E0 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Brinp3Q499E0 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Brinp3Q499E0 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Brinp3Q499E0 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Brinp3Q499E0 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Brinp3Q499E0 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Brinp3Q499E0 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Brinp3Q499E0 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Brinp3Q499E0 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Brinp3Q499E0 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Brinp3Q499E0 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Brinp3Q499E0 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Brinp3Q499E0 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Brinp3Q499E0 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Brinp3Q499E0 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Brinp3Q499E0 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Brinp3Q499E0 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Brinp3Q499E0 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Brinp3Q499E0 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Brinp3Q499E0 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Brinp3Q499E0 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Brinp3Q499E0 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Brinp3Q499E0 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Brinp3Q499E0 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Brinp3Q499E0 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Brinp3Q499E0 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Brinp3Q499E0 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Brinp3Q499E0 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Brinp3Q499E0 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Brinp3Q499E0 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Brinp3Q499E0 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Brinp3Q499E0 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Brinp3Q499E0 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Brinp3Q499E0 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Brinp3Q499E0 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Brinp3Q499E0 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Brinp3Q499E0 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Brinp3Q499E0 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Brinp3Q499E0 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Brinp3Q499E0 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Brinp3Q499E0 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Brinp3Q499E0 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Brinp3Q499E0 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Brinp3Q499E0 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Brinp3Q499E0 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Brinp3Q499E0 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Brinp3Q499E0 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Brinp3Q499E0 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Brinp3Q499E0 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Brinp3Q499E0 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Brinp3Q499E0 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Brinp3Q499E0 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Brinp3Q499E0 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Brinp3Q499E0 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Brinp3Q499E0 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Brinp3Q499E0 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Brinp3Q499E0 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Brinp3Q499E0 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms