Protein–RNA interactions for Protein: Q497S0

Gm5935, EG546282 protein, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5935Q497S0 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm5935Q497S0 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm5935Q497S0 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm5935Q497S0 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm5935Q497S0 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm5935Q497S0 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm5935Q497S0 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm5935Q497S0 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm5935Q497S0 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm5935Q497S0 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm5935Q497S0 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm5935Q497S0 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm5935Q497S0 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm5935Q497S0 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm5935Q497S0 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm5935Q497S0 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm5935Q497S0 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm5935Q497S0 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm5935Q497S0 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm5935Q497S0 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm5935Q497S0 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm5935Q497S0 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm5935Q497S0 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm5935Q497S0 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm5935Q497S0 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm5935Q497S0 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm5935Q497S0 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm5935Q497S0 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm5935Q497S0 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm5935Q497S0 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm5935Q497S0 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm5935Q497S0 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm5935Q497S0 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm5935Q497S0 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm5935Q497S0 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm5935Q497S0 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm5935Q497S0 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm5935Q497S0 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm5935Q497S0 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm5935Q497S0 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm5935Q497S0 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm5935Q497S0 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm5935Q497S0 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm5935Q497S0 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm5935Q497S0 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm5935Q497S0 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm5935Q497S0 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm5935Q497S0 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm5935Q497S0 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm5935Q497S0 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm5935Q497S0 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm5935Q497S0 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm5935Q497S0 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm5935Q497S0 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm5935Q497S0 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm5935Q497S0 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm5935Q497S0 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm5935Q497S0 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm5935Q497S0 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm5935Q497S0 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm5935Q497S0 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm5935Q497S0 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm5935Q497S0 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm5935Q497S0 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm5935Q497S0 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm5935Q497S0 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm5935Q497S0 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm5935Q497S0 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm5935Q497S0 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm5935Q497S0 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm5935Q497S0 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm5935Q497S0 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm5935Q497S0 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm5935Q497S0 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm5935Q497S0 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm5935Q497S0 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm5935Q497S0 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm5935Q497S0 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm5935Q497S0 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm5935Q497S0 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm5935Q497S0 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm5935Q497S0 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm5935Q497S0 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm5935Q497S0 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm5935Q497S0 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm5935Q497S0 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm5935Q497S0 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm5935Q497S0 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm5935Q497S0 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm5935Q497S0 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm5935Q497S0 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm5935Q497S0 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm5935Q497S0 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm5935Q497S0 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm5935Q497S0 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm5935Q497S0 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm5935Q497S0 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm5935Q497S0 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm5935Q497S0 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm5935Q497S0 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms