Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0Q1

Dnah12, Dynein heavy chain 12, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 3,086 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnah12Q3V0Q1 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Dnah12Q3V0Q1 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dnah12Q3V0Q1 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dnah12Q3V0Q1 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dnah12Q3V0Q1 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dnah12Q3V0Q1 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Dnah12Q3V0Q1 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Dnah12Q3V0Q1 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Dnah12Q3V0Q1 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Dnah12Q3V0Q1 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Dnah12Q3V0Q1 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Dnah12Q3V0Q1 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Dnah12Q3V0Q1 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Dnah12Q3V0Q1 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Dnah12Q3V0Q1 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Dnah12Q3V0Q1 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Dnah12Q3V0Q1 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Dnah12Q3V0Q1 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Dnah12Q3V0Q1 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Dnah12Q3V0Q1 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Dnah12Q3V0Q1 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Dnah12Q3V0Q1 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Dnah12Q3V0Q1 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Dnah12Q3V0Q1 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Dnah12Q3V0Q1 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Dnah12Q3V0Q1 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Dnah12Q3V0Q1 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Dnah12Q3V0Q1 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Dnah12Q3V0Q1 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Dnah12Q3V0Q1 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Dnah12Q3V0Q1 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Dnah12Q3V0Q1 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Dnah12Q3V0Q1 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Dnah12Q3V0Q1 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Dnah12Q3V0Q1 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Dnah12Q3V0Q1 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Dnah12Q3V0Q1 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dnah12Q3V0Q1 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dnah12Q3V0Q1 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dnah12Q3V0Q1 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dnah12Q3V0Q1 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dnah12Q3V0Q1 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dnah12Q3V0Q1 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dnah12Q3V0Q1 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dnah12Q3V0Q1 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dnah12Q3V0Q1 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dnah12Q3V0Q1 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dnah12Q3V0Q1 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dnah12Q3V0Q1 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dnah12Q3V0Q1 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dnah12Q3V0Q1 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dnah12Q3V0Q1 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dnah12Q3V0Q1 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dnah12Q3V0Q1 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dnah12Q3V0Q1 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dnah12Q3V0Q1 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dnah12Q3V0Q1 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Dnah12Q3V0Q1 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dnah12Q3V0Q1 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dnah12Q3V0Q1 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dnah12Q3V0Q1 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Dnah12Q3V0Q1 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Dnah12Q3V0Q1 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dnah12Q3V0Q1 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dnah12Q3V0Q1 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dnah12Q3V0Q1 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dnah12Q3V0Q1 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dnah12Q3V0Q1 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dnah12Q3V0Q1 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dnah12Q3V0Q1 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dnah12Q3V0Q1 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dnah12Q3V0Q1 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dnah12Q3V0Q1 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dnah12Q3V0Q1 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dnah12Q3V0Q1 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dnah12Q3V0Q1 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dnah12Q3V0Q1 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dnah12Q3V0Q1 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dnah12Q3V0Q1 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dnah12Q3V0Q1 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dnah12Q3V0Q1 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dnah12Q3V0Q1 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dnah12Q3V0Q1 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dnah12Q3V0Q1 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dnah12Q3V0Q1 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dnah12Q3V0Q1 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dnah12Q3V0Q1 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dnah12Q3V0Q1 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dnah12Q3V0Q1 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dnah12Q3V0Q1 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dnah12Q3V0Q1 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dnah12Q3V0Q1 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Dnah12Q3V0Q1 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dnah12Q3V0Q1 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dnah12Q3V0Q1 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dnah12Q3V0Q1 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dnah12Q3V0Q1 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dnah12Q3V0Q1 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dnah12Q3V0Q1 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dnah12Q3V0Q1 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms