Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0H9

4930596D02Rik, RIKEN cDNA 4930596D02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930596D02RikQ3V0H9 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
4930596D02RikQ3V0H9 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
4930596D02RikQ3V0H9 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
4930596D02RikQ3V0H9 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
4930596D02RikQ3V0H9 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
4930596D02RikQ3V0H9 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
4930596D02RikQ3V0H9 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
4930596D02RikQ3V0H9 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
4930596D02RikQ3V0H9 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
4930596D02RikQ3V0H9 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
4930596D02RikQ3V0H9 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
4930596D02RikQ3V0H9 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
4930596D02RikQ3V0H9 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
4930596D02RikQ3V0H9 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
4930596D02RikQ3V0H9 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
4930596D02RikQ3V0H9 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
4930596D02RikQ3V0H9 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
4930596D02RikQ3V0H9 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
4930596D02RikQ3V0H9 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
4930596D02RikQ3V0H9 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
4930596D02RikQ3V0H9 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
4930596D02RikQ3V0H9 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
4930596D02RikQ3V0H9 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
4930596D02RikQ3V0H9 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
4930596D02RikQ3V0H9 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
4930596D02RikQ3V0H9 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
4930596D02RikQ3V0H9 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
4930596D02RikQ3V0H9 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
4930596D02RikQ3V0H9 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
4930596D02RikQ3V0H9 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
4930596D02RikQ3V0H9 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
4930596D02RikQ3V0H9 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
4930596D02RikQ3V0H9 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
4930596D02RikQ3V0H9 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
4930596D02RikQ3V0H9 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
4930596D02RikQ3V0H9 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
4930596D02RikQ3V0H9 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
4930596D02RikQ3V0H9 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
4930596D02RikQ3V0H9 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
4930596D02RikQ3V0H9 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
4930596D02RikQ3V0H9 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
4930596D02RikQ3V0H9 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
4930596D02RikQ3V0H9 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
4930596D02RikQ3V0H9 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
4930596D02RikQ3V0H9 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
4930596D02RikQ3V0H9 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
4930596D02RikQ3V0H9 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
4930596D02RikQ3V0H9 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
4930596D02RikQ3V0H9 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
4930596D02RikQ3V0H9 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
4930596D02RikQ3V0H9 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
4930596D02RikQ3V0H9 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
4930596D02RikQ3V0H9 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
4930596D02RikQ3V0H9 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
4930596D02RikQ3V0H9 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
4930596D02RikQ3V0H9 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
4930596D02RikQ3V0H9 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
4930596D02RikQ3V0H9 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
4930596D02RikQ3V0H9 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
4930596D02RikQ3V0H9 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
4930596D02RikQ3V0H9 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
4930596D02RikQ3V0H9 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
4930596D02RikQ3V0H9 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
4930596D02RikQ3V0H9 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
4930596D02RikQ3V0H9 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
4930596D02RikQ3V0H9 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
4930596D02RikQ3V0H9 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
4930596D02RikQ3V0H9 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
4930596D02RikQ3V0H9 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
4930596D02RikQ3V0H9 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
4930596D02RikQ3V0H9 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
4930596D02RikQ3V0H9 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
4930596D02RikQ3V0H9 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
4930596D02RikQ3V0H9 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
4930596D02RikQ3V0H9 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
4930596D02RikQ3V0H9 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
4930596D02RikQ3V0H9 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
4930596D02RikQ3V0H9 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
4930596D02RikQ3V0H9 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
4930596D02RikQ3V0H9 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
4930596D02RikQ3V0H9 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
4930596D02RikQ3V0H9 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
4930596D02RikQ3V0H9 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
4930596D02RikQ3V0H9 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
4930596D02RikQ3V0H9 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
4930596D02RikQ3V0H9 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
4930596D02RikQ3V0H9 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
4930596D02RikQ3V0H9 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
4930596D02RikQ3V0H9 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
4930596D02RikQ3V0H9 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
4930596D02RikQ3V0H9 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
4930596D02RikQ3V0H9 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
4930596D02RikQ3V0H9 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
4930596D02RikQ3V0H9 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
4930596D02RikQ3V0H9 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
4930596D02RikQ3V0H9 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
4930596D02RikQ3V0H9 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
4930596D02RikQ3V0H9 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
4930596D02RikQ3V0H9 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
4930596D02RikQ3V0H9 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms