Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0F0

Rimbp3, RIMS-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rimbp3Q3V0F0 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rimbp3Q3V0F0 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rimbp3Q3V0F0 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rimbp3Q3V0F0 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Rimbp3Q3V0F0 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rimbp3Q3V0F0 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rimbp3Q3V0F0 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rimbp3Q3V0F0 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rimbp3Q3V0F0 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rimbp3Q3V0F0 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rimbp3Q3V0F0 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rimbp3Q3V0F0 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rimbp3Q3V0F0 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rimbp3Q3V0F0 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rimbp3Q3V0F0 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rimbp3Q3V0F0 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rimbp3Q3V0F0 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rimbp3Q3V0F0 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rimbp3Q3V0F0 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rimbp3Q3V0F0 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rimbp3Q3V0F0 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rimbp3Q3V0F0 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rimbp3Q3V0F0 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rimbp3Q3V0F0 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rimbp3Q3V0F0 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rimbp3Q3V0F0 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rimbp3Q3V0F0 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rimbp3Q3V0F0 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rimbp3Q3V0F0 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rimbp3Q3V0F0 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rimbp3Q3V0F0 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rimbp3Q3V0F0 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rimbp3Q3V0F0 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rimbp3Q3V0F0 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rimbp3Q3V0F0 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Rimbp3Q3V0F0 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rimbp3Q3V0F0 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Rimbp3Q3V0F0 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rimbp3Q3V0F0 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rimbp3Q3V0F0 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rimbp3Q3V0F0 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rimbp3Q3V0F0 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rimbp3Q3V0F0 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rimbp3Q3V0F0 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rimbp3Q3V0F0 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rimbp3Q3V0F0 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rimbp3Q3V0F0 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Rimbp3Q3V0F0 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Rimbp3Q3V0F0 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rimbp3Q3V0F0 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rimbp3Q3V0F0 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rimbp3Q3V0F0 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rimbp3Q3V0F0 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rimbp3Q3V0F0 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rimbp3Q3V0F0 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rimbp3Q3V0F0 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Rimbp3Q3V0F0 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rimbp3Q3V0F0 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rimbp3Q3V0F0 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rimbp3Q3V0F0 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rimbp3Q3V0F0 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rimbp3Q3V0F0 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rimbp3Q3V0F0 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rimbp3Q3V0F0 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rimbp3Q3V0F0 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rimbp3Q3V0F0 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Rimbp3Q3V0F0 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rimbp3Q3V0F0 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rimbp3Q3V0F0 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rimbp3Q3V0F0 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Rimbp3Q3V0F0 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rimbp3Q3V0F0 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Rimbp3Q3V0F0 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rimbp3Q3V0F0 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rimbp3Q3V0F0 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rimbp3Q3V0F0 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rimbp3Q3V0F0 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rimbp3Q3V0F0 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rimbp3Q3V0F0 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rimbp3Q3V0F0 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rimbp3Q3V0F0 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rimbp3Q3V0F0 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rimbp3Q3V0F0 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rimbp3Q3V0F0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rimbp3Q3V0F0 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rimbp3Q3V0F0 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rimbp3Q3V0F0 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rimbp3Q3V0F0 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rimbp3Q3V0F0 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rimbp3Q3V0F0 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Rimbp3Q3V0F0 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rimbp3Q3V0F0 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rimbp3Q3V0F0 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rimbp3Q3V0F0 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Rimbp3Q3V0F0 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rimbp3Q3V0F0 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rimbp3Q3V0F0 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rimbp3Q3V0F0 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rimbp3Q3V0F0 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rimbp3Q3V0F0 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms