Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ01

Rnpc3, RNA-binding protein 40, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnpc3Q3UZ01 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rnpc3Q3UZ01 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rnpc3Q3UZ01 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Rnpc3Q3UZ01 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Rnpc3Q3UZ01 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Rnpc3Q3UZ01 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Rnpc3Q3UZ01 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rnpc3Q3UZ01 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Rnpc3Q3UZ01 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Rnpc3Q3UZ01 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rnpc3Q3UZ01 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Rnpc3Q3UZ01 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Rnpc3Q3UZ01 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Rnpc3Q3UZ01 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rnpc3Q3UZ01 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rnpc3Q3UZ01 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rnpc3Q3UZ01 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rnpc3Q3UZ01 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rnpc3Q3UZ01 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rnpc3Q3UZ01 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rnpc3Q3UZ01 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rnpc3Q3UZ01 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Rnpc3Q3UZ01 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Rnpc3Q3UZ01 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rnpc3Q3UZ01 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rnpc3Q3UZ01 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rnpc3Q3UZ01 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rnpc3Q3UZ01 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rnpc3Q3UZ01 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rnpc3Q3UZ01 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rnpc3Q3UZ01 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rnpc3Q3UZ01 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rnpc3Q3UZ01 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rnpc3Q3UZ01 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rnpc3Q3UZ01 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rnpc3Q3UZ01 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rnpc3Q3UZ01 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rnpc3Q3UZ01 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rnpc3Q3UZ01 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rnpc3Q3UZ01 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rnpc3Q3UZ01 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rnpc3Q3UZ01 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rnpc3Q3UZ01 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rnpc3Q3UZ01 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rnpc3Q3UZ01 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rnpc3Q3UZ01 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rnpc3Q3UZ01 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rnpc3Q3UZ01 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rnpc3Q3UZ01 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rnpc3Q3UZ01 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rnpc3Q3UZ01 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rnpc3Q3UZ01 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rnpc3Q3UZ01 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rnpc3Q3UZ01 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rnpc3Q3UZ01 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rnpc3Q3UZ01 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rnpc3Q3UZ01 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rnpc3Q3UZ01 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rnpc3Q3UZ01 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rnpc3Q3UZ01 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rnpc3Q3UZ01 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rnpc3Q3UZ01 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rnpc3Q3UZ01 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rnpc3Q3UZ01 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rnpc3Q3UZ01 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rnpc3Q3UZ01 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rnpc3Q3UZ01 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rnpc3Q3UZ01 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Rnpc3Q3UZ01 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rnpc3Q3UZ01 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Rnpc3Q3UZ01 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rnpc3Q3UZ01 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rnpc3Q3UZ01 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rnpc3Q3UZ01 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rnpc3Q3UZ01 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rnpc3Q3UZ01 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rnpc3Q3UZ01 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rnpc3Q3UZ01 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rnpc3Q3UZ01 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rnpc3Q3UZ01 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rnpc3Q3UZ01 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rnpc3Q3UZ01 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rnpc3Q3UZ01 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rnpc3Q3UZ01 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rnpc3Q3UZ01 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Rnpc3Q3UZ01 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rnpc3Q3UZ01 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rnpc3Q3UZ01 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rnpc3Q3UZ01 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rnpc3Q3UZ01 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rnpc3Q3UZ01 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Rnpc3Q3UZ01 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rnpc3Q3UZ01 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Rnpc3Q3UZ01 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rnpc3Q3UZ01 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rnpc3Q3UZ01 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rnpc3Q3UZ01 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rnpc3Q3UZ01 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rnpc3Q3UZ01 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rnpc3Q3UZ01 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms