Protein–RNA interactions for Protein: Q3UXZ9

Kdm5a, Lysine-specific demethylase 5A, mousemouse

Predictions only

Length 1,690 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5aQ3UXZ9 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Kdm5aQ3UXZ9 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Kdm5aQ3UXZ9 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Kdm5aQ3UXZ9 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Kdm5aQ3UXZ9 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Kdm5aQ3UXZ9 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Kdm5aQ3UXZ9 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Kdm5aQ3UXZ9 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Kdm5aQ3UXZ9 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Kdm5aQ3UXZ9 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Kdm5aQ3UXZ9 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Kdm5aQ3UXZ9 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Kdm5aQ3UXZ9 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Kdm5aQ3UXZ9 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Kdm5aQ3UXZ9 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Kdm5aQ3UXZ9 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Kdm5aQ3UXZ9 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Kdm5aQ3UXZ9 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Kdm5aQ3UXZ9 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Kdm5aQ3UXZ9 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Kdm5aQ3UXZ9 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Kdm5aQ3UXZ9 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Kdm5aQ3UXZ9 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Kdm5aQ3UXZ9 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Kdm5aQ3UXZ9 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Kdm5aQ3UXZ9 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Kdm5aQ3UXZ9 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Kdm5aQ3UXZ9 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Kdm5aQ3UXZ9 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Kdm5aQ3UXZ9 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Kdm5aQ3UXZ9 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Kdm5aQ3UXZ9 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Kdm5aQ3UXZ9 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Kdm5aQ3UXZ9 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Kdm5aQ3UXZ9 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Kdm5aQ3UXZ9 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Kdm5aQ3UXZ9 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Kdm5aQ3UXZ9 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Kdm5aQ3UXZ9 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Kdm5aQ3UXZ9 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Kdm5aQ3UXZ9 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Kdm5aQ3UXZ9 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Kdm5aQ3UXZ9 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Kdm5aQ3UXZ9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Kdm5aQ3UXZ9 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Kdm5aQ3UXZ9 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Kdm5aQ3UXZ9 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Kdm5aQ3UXZ9 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Kdm5aQ3UXZ9 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Kdm5aQ3UXZ9 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Kdm5aQ3UXZ9 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Kdm5aQ3UXZ9 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Kdm5aQ3UXZ9 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Kdm5aQ3UXZ9 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Kdm5aQ3UXZ9 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Kdm5aQ3UXZ9 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Kdm5aQ3UXZ9 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Kdm5aQ3UXZ9 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Kdm5aQ3UXZ9 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Kdm5aQ3UXZ9 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Kdm5aQ3UXZ9 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Kdm5aQ3UXZ9 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Kdm5aQ3UXZ9 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Kdm5aQ3UXZ9 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Kdm5aQ3UXZ9 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Kdm5aQ3UXZ9 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Kdm5aQ3UXZ9 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Kdm5aQ3UXZ9 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Kdm5aQ3UXZ9 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Kdm5aQ3UXZ9 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Kdm5aQ3UXZ9 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Kdm5aQ3UXZ9 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Kdm5aQ3UXZ9 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Kdm5aQ3UXZ9 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Kdm5aQ3UXZ9 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Kdm5aQ3UXZ9 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Kdm5aQ3UXZ9 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Kdm5aQ3UXZ9 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Kdm5aQ3UXZ9 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Kdm5aQ3UXZ9 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Kdm5aQ3UXZ9 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Kdm5aQ3UXZ9 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Kdm5aQ3UXZ9 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Kdm5aQ3UXZ9 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Kdm5aQ3UXZ9 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Kdm5aQ3UXZ9 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Kdm5aQ3UXZ9 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Kdm5aQ3UXZ9 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Kdm5aQ3UXZ9 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Kdm5aQ3UXZ9 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Kdm5aQ3UXZ9 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Kdm5aQ3UXZ9 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Kdm5aQ3UXZ9 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Kdm5aQ3UXZ9 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Kdm5aQ3UXZ9 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Kdm5aQ3UXZ9 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Kdm5aQ3UXZ9 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Kdm5aQ3UXZ9 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Kdm5aQ3UXZ9 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Kdm5aQ3UXZ9 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms