Protein–RNA interactions for Protein: Q3UX62

Ccdc114, Coiled-coil domain-containing protein 114, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc114Q3UX62 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc114Q3UX62 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc114Q3UX62 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc114Q3UX62 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc114Q3UX62 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc114Q3UX62 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc114Q3UX62 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc114Q3UX62 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc114Q3UX62 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc114Q3UX62 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc114Q3UX62 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc114Q3UX62 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc114Q3UX62 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc114Q3UX62 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc114Q3UX62 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc114Q3UX62 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc114Q3UX62 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc114Q3UX62 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc114Q3UX62 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc114Q3UX62 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc114Q3UX62 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc114Q3UX62 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc114Q3UX62 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc114Q3UX62 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc114Q3UX62 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc114Q3UX62 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc114Q3UX62 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc114Q3UX62 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc114Q3UX62 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc114Q3UX62 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc114Q3UX62 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc114Q3UX62 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc114Q3UX62 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc114Q3UX62 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc114Q3UX62 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc114Q3UX62 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc114Q3UX62 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc114Q3UX62 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc114Q3UX62 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc114Q3UX62 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc114Q3UX62 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc114Q3UX62 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc114Q3UX62 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc114Q3UX62 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc114Q3UX62 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc114Q3UX62 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc114Q3UX62 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc114Q3UX62 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc114Q3UX62 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc114Q3UX62 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc114Q3UX62 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc114Q3UX62 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc114Q3UX62 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc114Q3UX62 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc114Q3UX62 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc114Q3UX62 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc114Q3UX62 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc114Q3UX62 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc114Q3UX62 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc114Q3UX62 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc114Q3UX62 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc114Q3UX62 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc114Q3UX62 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc114Q3UX62 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc114Q3UX62 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc114Q3UX62 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc114Q3UX62 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc114Q3UX62 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc114Q3UX62 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc114Q3UX62 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc114Q3UX62 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc114Q3UX62 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc114Q3UX62 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc114Q3UX62 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc114Q3UX62 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc114Q3UX62 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc114Q3UX62 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc114Q3UX62 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc114Q3UX62 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc114Q3UX62 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc114Q3UX62 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc114Q3UX62 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc114Q3UX62 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc114Q3UX62 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc114Q3UX62 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc114Q3UX62 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc114Q3UX62 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc114Q3UX62 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc114Q3UX62 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc114Q3UX62 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc114Q3UX62 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc114Q3UX62 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc114Q3UX62 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc114Q3UX62 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc114Q3UX62 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc114Q3UX62 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc114Q3UX62 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc114Q3UX62 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc114Q3UX62 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc114Q3UX62 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms