Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW13

D130052B06Rik, RIKEN cDNA D130052B06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D130052B06RikQ3UW13 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
D130052B06RikQ3UW13 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
D130052B06RikQ3UW13 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
D130052B06RikQ3UW13 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
D130052B06RikQ3UW13 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
D130052B06RikQ3UW13 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
D130052B06RikQ3UW13 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
D130052B06RikQ3UW13 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
D130052B06RikQ3UW13 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
D130052B06RikQ3UW13 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
D130052B06RikQ3UW13 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
D130052B06RikQ3UW13 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
D130052B06RikQ3UW13 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
D130052B06RikQ3UW13 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
D130052B06RikQ3UW13 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
D130052B06RikQ3UW13 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
D130052B06RikQ3UW13 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
D130052B06RikQ3UW13 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
D130052B06RikQ3UW13 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
D130052B06RikQ3UW13 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
D130052B06RikQ3UW13 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
D130052B06RikQ3UW13 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
D130052B06RikQ3UW13 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
D130052B06RikQ3UW13 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
D130052B06RikQ3UW13 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
D130052B06RikQ3UW13 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
D130052B06RikQ3UW13 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
D130052B06RikQ3UW13 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
D130052B06RikQ3UW13 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
D130052B06RikQ3UW13 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
D130052B06RikQ3UW13 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
D130052B06RikQ3UW13 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
D130052B06RikQ3UW13 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
D130052B06RikQ3UW13 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
D130052B06RikQ3UW13 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
D130052B06RikQ3UW13 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
D130052B06RikQ3UW13 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
D130052B06RikQ3UW13 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
D130052B06RikQ3UW13 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
D130052B06RikQ3UW13 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
D130052B06RikQ3UW13 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
D130052B06RikQ3UW13 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
D130052B06RikQ3UW13 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
D130052B06RikQ3UW13 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
D130052B06RikQ3UW13 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
D130052B06RikQ3UW13 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
D130052B06RikQ3UW13 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
D130052B06RikQ3UW13 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
D130052B06RikQ3UW13 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
D130052B06RikQ3UW13 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
D130052B06RikQ3UW13 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
D130052B06RikQ3UW13 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.54
D130052B06RikQ3UW13 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
D130052B06RikQ3UW13 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
D130052B06RikQ3UW13 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
D130052B06RikQ3UW13 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
D130052B06RikQ3UW13 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
D130052B06RikQ3UW13 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
D130052B06RikQ3UW13 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
D130052B06RikQ3UW13 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
D130052B06RikQ3UW13 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
D130052B06RikQ3UW13 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
D130052B06RikQ3UW13 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
D130052B06RikQ3UW13 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
D130052B06RikQ3UW13 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
D130052B06RikQ3UW13 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
D130052B06RikQ3UW13 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
D130052B06RikQ3UW13 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
D130052B06RikQ3UW13 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
D130052B06RikQ3UW13 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
D130052B06RikQ3UW13 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
D130052B06RikQ3UW13 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
D130052B06RikQ3UW13 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
D130052B06RikQ3UW13 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
D130052B06RikQ3UW13 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
D130052B06RikQ3UW13 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
D130052B06RikQ3UW13 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
D130052B06RikQ3UW13 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
D130052B06RikQ3UW13 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
D130052B06RikQ3UW13 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
D130052B06RikQ3UW13 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
D130052B06RikQ3UW13 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
D130052B06RikQ3UW13 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
D130052B06RikQ3UW13 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
D130052B06RikQ3UW13 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
D130052B06RikQ3UW13 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
D130052B06RikQ3UW13 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
D130052B06RikQ3UW13 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
D130052B06RikQ3UW13 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
D130052B06RikQ3UW13 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
D130052B06RikQ3UW13 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
D130052B06RikQ3UW13 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
D130052B06RikQ3UW13 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
D130052B06RikQ3UW13 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
D130052B06RikQ3UW13 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
D130052B06RikQ3UW13 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
D130052B06RikQ3UW13 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
D130052B06RikQ3UW13 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
D130052B06RikQ3UW13 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
D130052B06RikQ3UW13 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms