Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW12

Cnga4, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga4Q3UW12 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cnga4Q3UW12 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cnga4Q3UW12 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cnga4Q3UW12 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cnga4Q3UW12 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cnga4Q3UW12 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cnga4Q3UW12 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cnga4Q3UW12 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cnga4Q3UW12 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cnga4Q3UW12 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cnga4Q3UW12 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cnga4Q3UW12 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cnga4Q3UW12 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cnga4Q3UW12 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cnga4Q3UW12 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cnga4Q3UW12 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cnga4Q3UW12 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cnga4Q3UW12 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cnga4Q3UW12 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cnga4Q3UW12 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cnga4Q3UW12 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cnga4Q3UW12 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cnga4Q3UW12 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Cnga4Q3UW12 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cnga4Q3UW12 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Cnga4Q3UW12 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cnga4Q3UW12 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cnga4Q3UW12 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cnga4Q3UW12 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cnga4Q3UW12 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Cnga4Q3UW12 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cnga4Q3UW12 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cnga4Q3UW12 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cnga4Q3UW12 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cnga4Q3UW12 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cnga4Q3UW12 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cnga4Q3UW12 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cnga4Q3UW12 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cnga4Q3UW12 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cnga4Q3UW12 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cnga4Q3UW12 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cnga4Q3UW12 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Cnga4Q3UW12 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cnga4Q3UW12 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cnga4Q3UW12 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cnga4Q3UW12 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cnga4Q3UW12 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cnga4Q3UW12 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cnga4Q3UW12 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cnga4Q3UW12 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cnga4Q3UW12 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cnga4Q3UW12 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cnga4Q3UW12 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cnga4Q3UW12 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cnga4Q3UW12 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cnga4Q3UW12 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cnga4Q3UW12 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cnga4Q3UW12 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cnga4Q3UW12 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cnga4Q3UW12 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cnga4Q3UW12 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cnga4Q3UW12 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cnga4Q3UW12 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cnga4Q3UW12 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cnga4Q3UW12 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cnga4Q3UW12 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cnga4Q3UW12 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cnga4Q3UW12 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cnga4Q3UW12 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cnga4Q3UW12 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cnga4Q3UW12 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cnga4Q3UW12 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cnga4Q3UW12 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cnga4Q3UW12 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cnga4Q3UW12 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cnga4Q3UW12 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cnga4Q3UW12 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cnga4Q3UW12 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cnga4Q3UW12 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cnga4Q3UW12 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cnga4Q3UW12 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cnga4Q3UW12 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cnga4Q3UW12 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cnga4Q3UW12 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cnga4Q3UW12 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Cnga4Q3UW12 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cnga4Q3UW12 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cnga4Q3UW12 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cnga4Q3UW12 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cnga4Q3UW12 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cnga4Q3UW12 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cnga4Q3UW12 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cnga4Q3UW12 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cnga4Q3UW12 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cnga4Q3UW12 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cnga4Q3UW12 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cnga4Q3UW12 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cnga4Q3UW12 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cnga4Q3UW12 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cnga4Q3UW12 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.6 ms