Protein–RNA interactions for Protein: Q3UUV9

H2-Eb2, Histocompatibility 2, class II antigen E beta2, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb2Q3UUV9 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-Eb2Q3UUV9 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-Eb2Q3UUV9 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-Eb2Q3UUV9 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-Eb2Q3UUV9 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-Eb2Q3UUV9 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-Eb2Q3UUV9 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2-Eb2Q3UUV9 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2-Eb2Q3UUV9 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
H2-Eb2Q3UUV9 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2-Eb2Q3UUV9 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2-Eb2Q3UUV9 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2-Eb2Q3UUV9 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2-Eb2Q3UUV9 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2-Eb2Q3UUV9 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2-Eb2Q3UUV9 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2-Eb2Q3UUV9 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2-Eb2Q3UUV9 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2-Eb2Q3UUV9 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2-Eb2Q3UUV9 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2-Eb2Q3UUV9 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
H2-Eb2Q3UUV9 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
H2-Eb2Q3UUV9 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
H2-Eb2Q3UUV9 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
H2-Eb2Q3UUV9 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
H2-Eb2Q3UUV9 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2-Eb2Q3UUV9 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2-Eb2Q3UUV9 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2-Eb2Q3UUV9 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2-Eb2Q3UUV9 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2-Eb2Q3UUV9 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2-Eb2Q3UUV9 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2-Eb2Q3UUV9 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2-Eb2Q3UUV9 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2-Eb2Q3UUV9 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2-Eb2Q3UUV9 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2-Eb2Q3UUV9 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2-Eb2Q3UUV9 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2-Eb2Q3UUV9 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2-Eb2Q3UUV9 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2-Eb2Q3UUV9 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2-Eb2Q3UUV9 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
H2-Eb2Q3UUV9 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
H2-Eb2Q3UUV9 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2-Eb2Q3UUV9 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2-Eb2Q3UUV9 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2-Eb2Q3UUV9 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2-Eb2Q3UUV9 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2-Eb2Q3UUV9 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2-Eb2Q3UUV9 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2-Eb2Q3UUV9 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2-Eb2Q3UUV9 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2-Eb2Q3UUV9 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2-Eb2Q3UUV9 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2-Eb2Q3UUV9 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
H2-Eb2Q3UUV9 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
H2-Eb2Q3UUV9 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
H2-Eb2Q3UUV9 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2-Eb2Q3UUV9 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2-Eb2Q3UUV9 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2-Eb2Q3UUV9 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2-Eb2Q3UUV9 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2-Eb2Q3UUV9 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2-Eb2Q3UUV9 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2-Eb2Q3UUV9 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2-Eb2Q3UUV9 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2-Eb2Q3UUV9 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
H2-Eb2Q3UUV9 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2-Eb2Q3UUV9 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2-Eb2Q3UUV9 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2-Eb2Q3UUV9 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2-Eb2Q3UUV9 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-Eb2Q3UUV9 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-Eb2Q3UUV9 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-Eb2Q3UUV9 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-Eb2Q3UUV9 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-Eb2Q3UUV9 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-Eb2Q3UUV9 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-Eb2Q3UUV9 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-Eb2Q3UUV9 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-Eb2Q3UUV9 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-Eb2Q3UUV9 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-Eb2Q3UUV9 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-Eb2Q3UUV9 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-Eb2Q3UUV9 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-Eb2Q3UUV9 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-Eb2Q3UUV9 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-Eb2Q3UUV9 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-Eb2Q3UUV9 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-Eb2Q3UUV9 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-Eb2Q3UUV9 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-Eb2Q3UUV9 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-Eb2Q3UUV9 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-Eb2Q3UUV9 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-Eb2Q3UUV9 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-Eb2Q3UUV9 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-Eb2Q3UUV9 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-Eb2Q3UUV9 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-Eb2Q3UUV9 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-Eb2Q3UUV9 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms