Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
E130208F15RikQ3UPV3 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
E130208F15RikQ3UPV3 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
E130208F15RikQ3UPV3 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
E130208F15RikQ3UPV3 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
E130208F15RikQ3UPV3 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
E130208F15RikQ3UPV3 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
E130208F15RikQ3UPV3 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
E130208F15RikQ3UPV3 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
E130208F15RikQ3UPV3 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
E130208F15RikQ3UPV3 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
E130208F15RikQ3UPV3 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
E130208F15RikQ3UPV3 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
E130208F15RikQ3UPV3 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
E130208F15RikQ3UPV3 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
E130208F15RikQ3UPV3 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
E130208F15RikQ3UPV3 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
E130208F15RikQ3UPV3 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
E130208F15RikQ3UPV3 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
E130208F15RikQ3UPV3 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
E130208F15RikQ3UPV3 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
E130208F15RikQ3UPV3 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
E130208F15RikQ3UPV3 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
E130208F15RikQ3UPV3 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
E130208F15RikQ3UPV3 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
E130208F15RikQ3UPV3 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
E130208F15RikQ3UPV3 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
E130208F15RikQ3UPV3 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
E130208F15RikQ3UPV3 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
E130208F15RikQ3UPV3 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
E130208F15RikQ3UPV3 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
E130208F15RikQ3UPV3 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
E130208F15RikQ3UPV3 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
E130208F15RikQ3UPV3 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
E130208F15RikQ3UPV3 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
E130208F15RikQ3UPV3 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
E130208F15RikQ3UPV3 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
E130208F15RikQ3UPV3 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
E130208F15RikQ3UPV3 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
E130208F15RikQ3UPV3 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
E130208F15RikQ3UPV3 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
E130208F15RikQ3UPV3 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
E130208F15RikQ3UPV3 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
E130208F15RikQ3UPV3 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
E130208F15RikQ3UPV3 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
E130208F15RikQ3UPV3 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
E130208F15RikQ3UPV3 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
E130208F15RikQ3UPV3 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
E130208F15RikQ3UPV3 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
E130208F15RikQ3UPV3 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
E130208F15RikQ3UPV3 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
E130208F15RikQ3UPV3 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
E130208F15RikQ3UPV3 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
E130208F15RikQ3UPV3 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
E130208F15RikQ3UPV3 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
E130208F15RikQ3UPV3 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
E130208F15RikQ3UPV3 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
E130208F15RikQ3UPV3 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
E130208F15RikQ3UPV3 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
E130208F15RikQ3UPV3 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
E130208F15RikQ3UPV3 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
E130208F15RikQ3UPV3 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
E130208F15RikQ3UPV3 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
E130208F15RikQ3UPV3 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
E130208F15RikQ3UPV3 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
E130208F15RikQ3UPV3 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
E130208F15RikQ3UPV3 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
E130208F15RikQ3UPV3 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
E130208F15RikQ3UPV3 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
E130208F15RikQ3UPV3 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
E130208F15RikQ3UPV3 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
E130208F15RikQ3UPV3 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
E130208F15RikQ3UPV3 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
E130208F15RikQ3UPV3 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
E130208F15RikQ3UPV3 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
E130208F15RikQ3UPV3 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
E130208F15RikQ3UPV3 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
E130208F15RikQ3UPV3 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
E130208F15RikQ3UPV3 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
E130208F15RikQ3UPV3 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
E130208F15RikQ3UPV3 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
E130208F15RikQ3UPV3 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
E130208F15RikQ3UPV3 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
E130208F15RikQ3UPV3 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
E130208F15RikQ3UPV3 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
E130208F15RikQ3UPV3 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
E130208F15RikQ3UPV3 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
E130208F15RikQ3UPV3 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
E130208F15RikQ3UPV3 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
E130208F15RikQ3UPV3 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
E130208F15RikQ3UPV3 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
E130208F15RikQ3UPV3 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
E130208F15RikQ3UPV3 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
E130208F15RikQ3UPV3 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
E130208F15RikQ3UPV3 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
E130208F15RikQ3UPV3 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms