Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPH7

Arhgef40, Rho guanine nucleotide exchange factor 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgef40Q3UPH7 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Arhgef40Q3UPH7 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Arhgef40Q3UPH7 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Arhgef40Q3UPH7 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Arhgef40Q3UPH7 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Arhgef40Q3UPH7 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Arhgef40Q3UPH7 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Arhgef40Q3UPH7 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Arhgef40Q3UPH7 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Arhgef40Q3UPH7 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Arhgef40Q3UPH7 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Arhgef40Q3UPH7 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Arhgef40Q3UPH7 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Arhgef40Q3UPH7 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Arhgef40Q3UPH7 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Arhgef40Q3UPH7 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Arhgef40Q3UPH7 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Arhgef40Q3UPH7 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Arhgef40Q3UPH7 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Arhgef40Q3UPH7 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Arhgef40Q3UPH7 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Arhgef40Q3UPH7 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Arhgef40Q3UPH7 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Arhgef40Q3UPH7 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Arhgef40Q3UPH7 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Arhgef40Q3UPH7 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Arhgef40Q3UPH7 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Arhgef40Q3UPH7 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Arhgef40Q3UPH7 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Arhgef40Q3UPH7 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Arhgef40Q3UPH7 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Arhgef40Q3UPH7 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Arhgef40Q3UPH7 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Arhgef40Q3UPH7 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Arhgef40Q3UPH7 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Arhgef40Q3UPH7 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Arhgef40Q3UPH7 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Arhgef40Q3UPH7 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Arhgef40Q3UPH7 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Arhgef40Q3UPH7 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Arhgef40Q3UPH7 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Arhgef40Q3UPH7 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Arhgef40Q3UPH7 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Arhgef40Q3UPH7 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Arhgef40Q3UPH7 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Arhgef40Q3UPH7 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Arhgef40Q3UPH7 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Arhgef40Q3UPH7 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Arhgef40Q3UPH7 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Arhgef40Q3UPH7 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Arhgef40Q3UPH7 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Arhgef40Q3UPH7 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Arhgef40Q3UPH7 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Arhgef40Q3UPH7 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Arhgef40Q3UPH7 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Arhgef40Q3UPH7 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Arhgef40Q3UPH7 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Arhgef40Q3UPH7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Arhgef40Q3UPH7 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Arhgef40Q3UPH7 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Arhgef40Q3UPH7 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Arhgef40Q3UPH7 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Arhgef40Q3UPH7 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Arhgef40Q3UPH7 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Arhgef40Q3UPH7 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Arhgef40Q3UPH7 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Arhgef40Q3UPH7 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Arhgef40Q3UPH7 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Arhgef40Q3UPH7 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Arhgef40Q3UPH7 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Arhgef40Q3UPH7 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Arhgef40Q3UPH7 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Arhgef40Q3UPH7 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Arhgef40Q3UPH7 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Arhgef40Q3UPH7 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Arhgef40Q3UPH7 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Arhgef40Q3UPH7 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Arhgef40Q3UPH7 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Arhgef40Q3UPH7 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Arhgef40Q3UPH7 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Arhgef40Q3UPH7 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Arhgef40Q3UPH7 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Arhgef40Q3UPH7 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Arhgef40Q3UPH7 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Arhgef40Q3UPH7 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Arhgef40Q3UPH7 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Arhgef40Q3UPH7 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Arhgef40Q3UPH7 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Arhgef40Q3UPH7 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Arhgef40Q3UPH7 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Arhgef40Q3UPH7 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Arhgef40Q3UPH7 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Arhgef40Q3UPH7 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Arhgef40Q3UPH7 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Arhgef40Q3UPH7 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Arhgef40Q3UPH7 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Arhgef40Q3UPH7 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Arhgef40Q3UPH7 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC25■■□□□ 1.59
Arhgef40Q3UPH7 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Arhgef40Q3UPH7 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms