Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP44

Nhlrc4, NHL-repeat-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc4Q3UP44 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nhlrc4Q3UP44 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Nhlrc4Q3UP44 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nhlrc4Q3UP44 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nhlrc4Q3UP44 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nhlrc4Q3UP44 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nhlrc4Q3UP44 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nhlrc4Q3UP44 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nhlrc4Q3UP44 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nhlrc4Q3UP44 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nhlrc4Q3UP44 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nhlrc4Q3UP44 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nhlrc4Q3UP44 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nhlrc4Q3UP44 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nhlrc4Q3UP44 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nhlrc4Q3UP44 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nhlrc4Q3UP44 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nhlrc4Q3UP44 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nhlrc4Q3UP44 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nhlrc4Q3UP44 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nhlrc4Q3UP44 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nhlrc4Q3UP44 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nhlrc4Q3UP44 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nhlrc4Q3UP44 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nhlrc4Q3UP44 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Nhlrc4Q3UP44 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nhlrc4Q3UP44 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nhlrc4Q3UP44 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nhlrc4Q3UP44 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nhlrc4Q3UP44 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nhlrc4Q3UP44 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nhlrc4Q3UP44 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nhlrc4Q3UP44 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nhlrc4Q3UP44 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Nhlrc4Q3UP44 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nhlrc4Q3UP44 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nhlrc4Q3UP44 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nhlrc4Q3UP44 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nhlrc4Q3UP44 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nhlrc4Q3UP44 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nhlrc4Q3UP44 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nhlrc4Q3UP44 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nhlrc4Q3UP44 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nhlrc4Q3UP44 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nhlrc4Q3UP44 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nhlrc4Q3UP44 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nhlrc4Q3UP44 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nhlrc4Q3UP44 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nhlrc4Q3UP44 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nhlrc4Q3UP44 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nhlrc4Q3UP44 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nhlrc4Q3UP44 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nhlrc4Q3UP44 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nhlrc4Q3UP44 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nhlrc4Q3UP44 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nhlrc4Q3UP44 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nhlrc4Q3UP44 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nhlrc4Q3UP44 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nhlrc4Q3UP44 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nhlrc4Q3UP44 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nhlrc4Q3UP44 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Nhlrc4Q3UP44 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nhlrc4Q3UP44 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Nhlrc4Q3UP44 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Nhlrc4Q3UP44 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nhlrc4Q3UP44 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nhlrc4Q3UP44 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nhlrc4Q3UP44 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nhlrc4Q3UP44 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nhlrc4Q3UP44 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nhlrc4Q3UP44 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nhlrc4Q3UP44 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nhlrc4Q3UP44 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nhlrc4Q3UP44 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nhlrc4Q3UP44 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Nhlrc4Q3UP44 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nhlrc4Q3UP44 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nhlrc4Q3UP44 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nhlrc4Q3UP44 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nhlrc4Q3UP44 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nhlrc4Q3UP44 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nhlrc4Q3UP44 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Nhlrc4Q3UP44 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nhlrc4Q3UP44 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nhlrc4Q3UP44 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nhlrc4Q3UP44 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nhlrc4Q3UP44 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nhlrc4Q3UP44 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nhlrc4Q3UP44 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nhlrc4Q3UP44 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nhlrc4Q3UP44 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nhlrc4Q3UP44 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nhlrc4Q3UP44 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nhlrc4Q3UP44 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nhlrc4Q3UP44 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nhlrc4Q3UP44 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nhlrc4Q3UP44 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nhlrc4Q3UP44 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nhlrc4Q3UP44 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nhlrc4Q3UP44 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms