Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

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Length 204 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem253Q3UNB8 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem253Q3UNB8 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem253Q3UNB8 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem253Q3UNB8 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem253Q3UNB8 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem253Q3UNB8 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem253Q3UNB8 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem253Q3UNB8 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem253Q3UNB8 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem253Q3UNB8 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem253Q3UNB8 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem253Q3UNB8 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem253Q3UNB8 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem253Q3UNB8 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem253Q3UNB8 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem253Q3UNB8 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem253Q3UNB8 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem253Q3UNB8 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem253Q3UNB8 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem253Q3UNB8 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem253Q3UNB8 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem253Q3UNB8 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem253Q3UNB8 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem253Q3UNB8 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem253Q3UNB8 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem253Q3UNB8 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmem253Q3UNB8 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmem253Q3UNB8 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmem253Q3UNB8 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmem253Q3UNB8 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmem253Q3UNB8 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmem253Q3UNB8 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmem253Q3UNB8 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmem253Q3UNB8 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem253Q3UNB8 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem253Q3UNB8 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem253Q3UNB8 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem253Q3UNB8 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem253Q3UNB8 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem253Q3UNB8 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem253Q3UNB8 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem253Q3UNB8 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem253Q3UNB8 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem253Q3UNB8 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem253Q3UNB8 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem253Q3UNB8 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem253Q3UNB8 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem253Q3UNB8 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem253Q3UNB8 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem253Q3UNB8 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem253Q3UNB8 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem253Q3UNB8 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem253Q3UNB8 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem253Q3UNB8 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem253Q3UNB8 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem253Q3UNB8 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem253Q3UNB8 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem253Q3UNB8 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem253Q3UNB8 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem253Q3UNB8 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem253Q3UNB8 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem253Q3UNB8 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem253Q3UNB8 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
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Tmem253Q3UNB8 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem253Q3UNB8 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem253Q3UNB8 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem253Q3UNB8 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem253Q3UNB8 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem253Q3UNB8 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem253Q3UNB8 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem253Q3UNB8 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem253Q3UNB8 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem253Q3UNB8 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem253Q3UNB8 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem253Q3UNB8 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem253Q3UNB8 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem253Q3UNB8 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem253Q3UNB8 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem253Q3UNB8 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem253Q3UNB8 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem253Q3UNB8 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem253Q3UNB8 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem253Q3UNB8 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem253Q3UNB8 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem253Q3UNB8 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem253Q3UNB8 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem253Q3UNB8 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem253Q3UNB8 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem253Q3UNB8 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem253Q3UNB8 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem253Q3UNB8 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem253Q3UNB8 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem253Q3UNB8 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem253Q3UNB8 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem253Q3UNB8 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem253Q3UNB8 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem253Q3UNB8 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem253Q3UNB8 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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