Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMF0

Cobll1, Cordon-bleu protein-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cobll1Q3UMF0 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cobll1Q3UMF0 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cobll1Q3UMF0 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cobll1Q3UMF0 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cobll1Q3UMF0 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cobll1Q3UMF0 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cobll1Q3UMF0 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cobll1Q3UMF0 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cobll1Q3UMF0 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cobll1Q3UMF0 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cobll1Q3UMF0 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cobll1Q3UMF0 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cobll1Q3UMF0 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cobll1Q3UMF0 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cobll1Q3UMF0 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cobll1Q3UMF0 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cobll1Q3UMF0 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cobll1Q3UMF0 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cobll1Q3UMF0 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cobll1Q3UMF0 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cobll1Q3UMF0 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cobll1Q3UMF0 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cobll1Q3UMF0 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cobll1Q3UMF0 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cobll1Q3UMF0 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cobll1Q3UMF0 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cobll1Q3UMF0 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cobll1Q3UMF0 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cobll1Q3UMF0 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cobll1Q3UMF0 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cobll1Q3UMF0 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cobll1Q3UMF0 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cobll1Q3UMF0 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cobll1Q3UMF0 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cobll1Q3UMF0 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cobll1Q3UMF0 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cobll1Q3UMF0 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cobll1Q3UMF0 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cobll1Q3UMF0 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cobll1Q3UMF0 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cobll1Q3UMF0 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cobll1Q3UMF0 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cobll1Q3UMF0 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cobll1Q3UMF0 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cobll1Q3UMF0 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cobll1Q3UMF0 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cobll1Q3UMF0 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cobll1Q3UMF0 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cobll1Q3UMF0 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cobll1Q3UMF0 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cobll1Q3UMF0 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cobll1Q3UMF0 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cobll1Q3UMF0 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cobll1Q3UMF0 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cobll1Q3UMF0 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cobll1Q3UMF0 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cobll1Q3UMF0 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cobll1Q3UMF0 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cobll1Q3UMF0 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cobll1Q3UMF0 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cobll1Q3UMF0 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cobll1Q3UMF0 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cobll1Q3UMF0 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cobll1Q3UMF0 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cobll1Q3UMF0 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cobll1Q3UMF0 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cobll1Q3UMF0 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cobll1Q3UMF0 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cobll1Q3UMF0 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cobll1Q3UMF0 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cobll1Q3UMF0 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cobll1Q3UMF0 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cobll1Q3UMF0 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cobll1Q3UMF0 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cobll1Q3UMF0 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cobll1Q3UMF0 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cobll1Q3UMF0 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cobll1Q3UMF0 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cobll1Q3UMF0 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cobll1Q3UMF0 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cobll1Q3UMF0 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cobll1Q3UMF0 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cobll1Q3UMF0 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cobll1Q3UMF0 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cobll1Q3UMF0 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cobll1Q3UMF0 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cobll1Q3UMF0 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cobll1Q3UMF0 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cobll1Q3UMF0 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cobll1Q3UMF0 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cobll1Q3UMF0 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cobll1Q3UMF0 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cobll1Q3UMF0 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cobll1Q3UMF0 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cobll1Q3UMF0 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cobll1Q3UMF0 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cobll1Q3UMF0 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cobll1Q3UMF0 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cobll1Q3UMF0 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cobll1Q3UMF0 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms