Protein–RNA interactions for Protein: Q3UM18

Lsg1, Large subunit GTPase 1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsg1Q3UM18 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lsg1Q3UM18 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lsg1Q3UM18 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lsg1Q3UM18 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lsg1Q3UM18 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lsg1Q3UM18 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lsg1Q3UM18 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lsg1Q3UM18 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lsg1Q3UM18 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lsg1Q3UM18 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lsg1Q3UM18 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lsg1Q3UM18 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lsg1Q3UM18 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lsg1Q3UM18 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lsg1Q3UM18 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lsg1Q3UM18 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lsg1Q3UM18 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lsg1Q3UM18 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lsg1Q3UM18 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lsg1Q3UM18 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lsg1Q3UM18 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Lsg1Q3UM18 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lsg1Q3UM18 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lsg1Q3UM18 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Lsg1Q3UM18 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lsg1Q3UM18 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Lsg1Q3UM18 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lsg1Q3UM18 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lsg1Q3UM18 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lsg1Q3UM18 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Lsg1Q3UM18 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lsg1Q3UM18 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lsg1Q3UM18 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lsg1Q3UM18 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lsg1Q3UM18 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lsg1Q3UM18 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lsg1Q3UM18 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lsg1Q3UM18 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lsg1Q3UM18 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lsg1Q3UM18 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lsg1Q3UM18 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lsg1Q3UM18 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lsg1Q3UM18 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lsg1Q3UM18 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lsg1Q3UM18 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lsg1Q3UM18 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lsg1Q3UM18 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lsg1Q3UM18 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lsg1Q3UM18 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lsg1Q3UM18 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lsg1Q3UM18 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lsg1Q3UM18 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lsg1Q3UM18 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lsg1Q3UM18 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lsg1Q3UM18 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Lsg1Q3UM18 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lsg1Q3UM18 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lsg1Q3UM18 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lsg1Q3UM18 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lsg1Q3UM18 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lsg1Q3UM18 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lsg1Q3UM18 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lsg1Q3UM18 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lsg1Q3UM18 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lsg1Q3UM18 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lsg1Q3UM18 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lsg1Q3UM18 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lsg1Q3UM18 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lsg1Q3UM18 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lsg1Q3UM18 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lsg1Q3UM18 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lsg1Q3UM18 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lsg1Q3UM18 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lsg1Q3UM18 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lsg1Q3UM18 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lsg1Q3UM18 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Lsg1Q3UM18 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lsg1Q3UM18 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lsg1Q3UM18 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lsg1Q3UM18 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lsg1Q3UM18 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lsg1Q3UM18 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Lsg1Q3UM18 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lsg1Q3UM18 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lsg1Q3UM18 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lsg1Q3UM18 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lsg1Q3UM18 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lsg1Q3UM18 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lsg1Q3UM18 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lsg1Q3UM18 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lsg1Q3UM18 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lsg1Q3UM18 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lsg1Q3UM18 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lsg1Q3UM18 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lsg1Q3UM18 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lsg1Q3UM18 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lsg1Q3UM18 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lsg1Q3UM18 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lsg1Q3UM18 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lsg1Q3UM18 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms