Protein–RNA interactions for Protein: Q3UL33

E330014E10Rik, Predicted gene 3286, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E330014E10RikQ3UL33 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
E330014E10RikQ3UL33 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
E330014E10RikQ3UL33 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
E330014E10RikQ3UL33 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
E330014E10RikQ3UL33 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
E330014E10RikQ3UL33 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
E330014E10RikQ3UL33 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
E330014E10RikQ3UL33 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
E330014E10RikQ3UL33 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
E330014E10RikQ3UL33 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
E330014E10RikQ3UL33 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
E330014E10RikQ3UL33 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
E330014E10RikQ3UL33 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
E330014E10RikQ3UL33 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
E330014E10RikQ3UL33 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
E330014E10RikQ3UL33 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
E330014E10RikQ3UL33 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
E330014E10RikQ3UL33 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
E330014E10RikQ3UL33 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
E330014E10RikQ3UL33 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
E330014E10RikQ3UL33 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
E330014E10RikQ3UL33 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
E330014E10RikQ3UL33 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
E330014E10RikQ3UL33 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
E330014E10RikQ3UL33 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
E330014E10RikQ3UL33 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
E330014E10RikQ3UL33 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
E330014E10RikQ3UL33 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
E330014E10RikQ3UL33 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
E330014E10RikQ3UL33 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
E330014E10RikQ3UL33 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
E330014E10RikQ3UL33 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
E330014E10RikQ3UL33 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
E330014E10RikQ3UL33 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
E330014E10RikQ3UL33 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
E330014E10RikQ3UL33 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
E330014E10RikQ3UL33 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
E330014E10RikQ3UL33 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
E330014E10RikQ3UL33 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
E330014E10RikQ3UL33 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
E330014E10RikQ3UL33 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
E330014E10RikQ3UL33 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
E330014E10RikQ3UL33 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
E330014E10RikQ3UL33 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
E330014E10RikQ3UL33 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
E330014E10RikQ3UL33 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
E330014E10RikQ3UL33 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
E330014E10RikQ3UL33 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
E330014E10RikQ3UL33 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
E330014E10RikQ3UL33 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
E330014E10RikQ3UL33 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
E330014E10RikQ3UL33 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
E330014E10RikQ3UL33 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
E330014E10RikQ3UL33 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
E330014E10RikQ3UL33 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
E330014E10RikQ3UL33 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
E330014E10RikQ3UL33 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
E330014E10RikQ3UL33 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
E330014E10RikQ3UL33 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
E330014E10RikQ3UL33 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
E330014E10RikQ3UL33 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
E330014E10RikQ3UL33 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
E330014E10RikQ3UL33 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
E330014E10RikQ3UL33 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
E330014E10RikQ3UL33 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
E330014E10RikQ3UL33 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
E330014E10RikQ3UL33 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
E330014E10RikQ3UL33 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
E330014E10RikQ3UL33 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
E330014E10RikQ3UL33 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
E330014E10RikQ3UL33 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
E330014E10RikQ3UL33 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
E330014E10RikQ3UL33 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
E330014E10RikQ3UL33 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
E330014E10RikQ3UL33 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
E330014E10RikQ3UL33 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
E330014E10RikQ3UL33 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
E330014E10RikQ3UL33 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
E330014E10RikQ3UL33 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
E330014E10RikQ3UL33 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
E330014E10RikQ3UL33 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
E330014E10RikQ3UL33 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
E330014E10RikQ3UL33 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
E330014E10RikQ3UL33 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
E330014E10RikQ3UL33 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
E330014E10RikQ3UL33 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
E330014E10RikQ3UL33 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
E330014E10RikQ3UL33 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
E330014E10RikQ3UL33 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
E330014E10RikQ3UL33 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
E330014E10RikQ3UL33 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
E330014E10RikQ3UL33 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
E330014E10RikQ3UL33 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
E330014E10RikQ3UL33 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
E330014E10RikQ3UL33 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
E330014E10RikQ3UL33 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
E330014E10RikQ3UL33 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
E330014E10RikQ3UL33 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
E330014E10RikQ3UL33 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
E330014E10RikQ3UL33 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms