Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJU9

Rmdn3, Regulator of microtubule dynamics protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rmdn3Q3UJU9 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rmdn3Q3UJU9 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rmdn3Q3UJU9 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rmdn3Q3UJU9 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rmdn3Q3UJU9 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rmdn3Q3UJU9 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rmdn3Q3UJU9 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rmdn3Q3UJU9 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rmdn3Q3UJU9 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rmdn3Q3UJU9 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rmdn3Q3UJU9 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rmdn3Q3UJU9 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rmdn3Q3UJU9 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rmdn3Q3UJU9 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rmdn3Q3UJU9 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rmdn3Q3UJU9 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rmdn3Q3UJU9 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rmdn3Q3UJU9 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Rmdn3Q3UJU9 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Rmdn3Q3UJU9 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rmdn3Q3UJU9 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rmdn3Q3UJU9 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rmdn3Q3UJU9 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rmdn3Q3UJU9 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rmdn3Q3UJU9 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rmdn3Q3UJU9 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rmdn3Q3UJU9 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rmdn3Q3UJU9 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rmdn3Q3UJU9 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rmdn3Q3UJU9 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rmdn3Q3UJU9 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rmdn3Q3UJU9 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rmdn3Q3UJU9 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rmdn3Q3UJU9 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rmdn3Q3UJU9 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rmdn3Q3UJU9 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rmdn3Q3UJU9 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rmdn3Q3UJU9 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rmdn3Q3UJU9 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rmdn3Q3UJU9 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rmdn3Q3UJU9 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rmdn3Q3UJU9 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rmdn3Q3UJU9 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rmdn3Q3UJU9 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rmdn3Q3UJU9 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rmdn3Q3UJU9 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rmdn3Q3UJU9 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rmdn3Q3UJU9 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rmdn3Q3UJU9 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rmdn3Q3UJU9 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rmdn3Q3UJU9 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rmdn3Q3UJU9 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Rmdn3Q3UJU9 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rmdn3Q3UJU9 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rmdn3Q3UJU9 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rmdn3Q3UJU9 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rmdn3Q3UJU9 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rmdn3Q3UJU9 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rmdn3Q3UJU9 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rmdn3Q3UJU9 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rmdn3Q3UJU9 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Rmdn3Q3UJU9 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rmdn3Q3UJU9 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rmdn3Q3UJU9 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rmdn3Q3UJU9 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rmdn3Q3UJU9 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rmdn3Q3UJU9 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rmdn3Q3UJU9 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Rmdn3Q3UJU9 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rmdn3Q3UJU9 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rmdn3Q3UJU9 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rmdn3Q3UJU9 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rmdn3Q3UJU9 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rmdn3Q3UJU9 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rmdn3Q3UJU9 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rmdn3Q3UJU9 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rmdn3Q3UJU9 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rmdn3Q3UJU9 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rmdn3Q3UJU9 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rmdn3Q3UJU9 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rmdn3Q3UJU9 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rmdn3Q3UJU9 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rmdn3Q3UJU9 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Rmdn3Q3UJU9 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rmdn3Q3UJU9 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rmdn3Q3UJU9 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rmdn3Q3UJU9 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Rmdn3Q3UJU9 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rmdn3Q3UJU9 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rmdn3Q3UJU9 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Rmdn3Q3UJU9 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rmdn3Q3UJU9 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rmdn3Q3UJU9 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rmdn3Q3UJU9 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rmdn3Q3UJU9 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rmdn3Q3UJU9 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rmdn3Q3UJU9 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rmdn3Q3UJU9 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rmdn3Q3UJU9 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rmdn3Q3UJU9 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms