Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJ22

Gm648, Gene model 648, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm648Q3UJ22 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm648Q3UJ22 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm648Q3UJ22 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm648Q3UJ22 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm648Q3UJ22 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm648Q3UJ22 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm648Q3UJ22 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm648Q3UJ22 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm648Q3UJ22 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm648Q3UJ22 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm648Q3UJ22 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm648Q3UJ22 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm648Q3UJ22 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm648Q3UJ22 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm648Q3UJ22 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm648Q3UJ22 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm648Q3UJ22 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm648Q3UJ22 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm648Q3UJ22 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm648Q3UJ22 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm648Q3UJ22 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm648Q3UJ22 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm648Q3UJ22 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm648Q3UJ22 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm648Q3UJ22 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm648Q3UJ22 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm648Q3UJ22 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm648Q3UJ22 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm648Q3UJ22 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm648Q3UJ22 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm648Q3UJ22 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm648Q3UJ22 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm648Q3UJ22 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm648Q3UJ22 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm648Q3UJ22 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm648Q3UJ22 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm648Q3UJ22 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm648Q3UJ22 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm648Q3UJ22 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm648Q3UJ22 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm648Q3UJ22 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm648Q3UJ22 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm648Q3UJ22 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm648Q3UJ22 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm648Q3UJ22 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm648Q3UJ22 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm648Q3UJ22 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm648Q3UJ22 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm648Q3UJ22 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm648Q3UJ22 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm648Q3UJ22 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm648Q3UJ22 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm648Q3UJ22 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm648Q3UJ22 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm648Q3UJ22 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm648Q3UJ22 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm648Q3UJ22 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm648Q3UJ22 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm648Q3UJ22 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm648Q3UJ22 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm648Q3UJ22 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm648Q3UJ22 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm648Q3UJ22 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm648Q3UJ22 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm648Q3UJ22 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm648Q3UJ22 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm648Q3UJ22 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm648Q3UJ22 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm648Q3UJ22 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm648Q3UJ22 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm648Q3UJ22 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm648Q3UJ22 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm648Q3UJ22 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm648Q3UJ22 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm648Q3UJ22 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm648Q3UJ22 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm648Q3UJ22 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm648Q3UJ22 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm648Q3UJ22 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm648Q3UJ22 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm648Q3UJ22 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm648Q3UJ22 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm648Q3UJ22 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm648Q3UJ22 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm648Q3UJ22 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm648Q3UJ22 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm648Q3UJ22 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm648Q3UJ22 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm648Q3UJ22 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm648Q3UJ22 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm648Q3UJ22 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm648Q3UJ22 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm648Q3UJ22 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm648Q3UJ22 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm648Q3UJ22 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm648Q3UJ22 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm648Q3UJ22 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm648Q3UJ22 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm648Q3UJ22 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm648Q3UJ22 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms