Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDP0

Wdr41, WD repeat-containing protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr41Q3UDP0 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Wdr41Q3UDP0 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Wdr41Q3UDP0 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Wdr41Q3UDP0 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Wdr41Q3UDP0 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Wdr41Q3UDP0 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Wdr41Q3UDP0 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Wdr41Q3UDP0 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Wdr41Q3UDP0 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Wdr41Q3UDP0 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Wdr41Q3UDP0 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Wdr41Q3UDP0 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Wdr41Q3UDP0 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Wdr41Q3UDP0 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Wdr41Q3UDP0 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Wdr41Q3UDP0 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Wdr41Q3UDP0 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Wdr41Q3UDP0 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Wdr41Q3UDP0 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Wdr41Q3UDP0 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Wdr41Q3UDP0 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Wdr41Q3UDP0 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Wdr41Q3UDP0 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Wdr41Q3UDP0 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Wdr41Q3UDP0 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Wdr41Q3UDP0 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Wdr41Q3UDP0 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Wdr41Q3UDP0 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Wdr41Q3UDP0 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Wdr41Q3UDP0 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Wdr41Q3UDP0 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Wdr41Q3UDP0 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Wdr41Q3UDP0 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Wdr41Q3UDP0 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Wdr41Q3UDP0 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Wdr41Q3UDP0 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Wdr41Q3UDP0 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Wdr41Q3UDP0 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Wdr41Q3UDP0 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Wdr41Q3UDP0 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Wdr41Q3UDP0 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Wdr41Q3UDP0 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Wdr41Q3UDP0 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Wdr41Q3UDP0 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Wdr41Q3UDP0 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Wdr41Q3UDP0 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Wdr41Q3UDP0 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Wdr41Q3UDP0 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Wdr41Q3UDP0 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Wdr41Q3UDP0 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Wdr41Q3UDP0 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Wdr41Q3UDP0 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Wdr41Q3UDP0 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Wdr41Q3UDP0 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Wdr41Q3UDP0 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Wdr41Q3UDP0 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Wdr41Q3UDP0 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Wdr41Q3UDP0 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Wdr41Q3UDP0 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Wdr41Q3UDP0 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Wdr41Q3UDP0 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Wdr41Q3UDP0 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Wdr41Q3UDP0 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Wdr41Q3UDP0 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Wdr41Q3UDP0 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Wdr41Q3UDP0 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Wdr41Q3UDP0 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Wdr41Q3UDP0 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Wdr41Q3UDP0 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Wdr41Q3UDP0 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Wdr41Q3UDP0 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Wdr41Q3UDP0 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Wdr41Q3UDP0 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Wdr41Q3UDP0 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Wdr41Q3UDP0 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Wdr41Q3UDP0 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Wdr41Q3UDP0 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Wdr41Q3UDP0 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Wdr41Q3UDP0 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Wdr41Q3UDP0 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Wdr41Q3UDP0 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Wdr41Q3UDP0 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Wdr41Q3UDP0 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Wdr41Q3UDP0 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Wdr41Q3UDP0 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Wdr41Q3UDP0 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Wdr41Q3UDP0 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Wdr41Q3UDP0 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Wdr41Q3UDP0 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Wdr41Q3UDP0 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Wdr41Q3UDP0 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Wdr41Q3UDP0 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Wdr41Q3UDP0 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Wdr41Q3UDP0 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Wdr41Q3UDP0 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Wdr41Q3UDP0 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Wdr41Q3UDP0 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Wdr41Q3UDP0 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Wdr41Q3UDP0 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Wdr41Q3UDP0 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms