Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDE2

Ttll12, Tubulin--tyrosine ligase-like protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll12Q3UDE2 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ttll12Q3UDE2 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ttll12Q3UDE2 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ttll12Q3UDE2 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ttll12Q3UDE2 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ttll12Q3UDE2 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ttll12Q3UDE2 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ttll12Q3UDE2 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ttll12Q3UDE2 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ttll12Q3UDE2 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ttll12Q3UDE2 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ttll12Q3UDE2 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ttll12Q3UDE2 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ttll12Q3UDE2 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ttll12Q3UDE2 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ttll12Q3UDE2 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ttll12Q3UDE2 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ttll12Q3UDE2 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ttll12Q3UDE2 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ttll12Q3UDE2 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ttll12Q3UDE2 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ttll12Q3UDE2 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ttll12Q3UDE2 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ttll12Q3UDE2 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ttll12Q3UDE2 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ttll12Q3UDE2 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ttll12Q3UDE2 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ttll12Q3UDE2 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ttll12Q3UDE2 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ttll12Q3UDE2 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ttll12Q3UDE2 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ttll12Q3UDE2 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ttll12Q3UDE2 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ttll12Q3UDE2 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ttll12Q3UDE2 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ttll12Q3UDE2 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ttll12Q3UDE2 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ttll12Q3UDE2 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ttll12Q3UDE2 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ttll12Q3UDE2 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ttll12Q3UDE2 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ttll12Q3UDE2 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ttll12Q3UDE2 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ttll12Q3UDE2 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ttll12Q3UDE2 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ttll12Q3UDE2 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ttll12Q3UDE2 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ttll12Q3UDE2 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ttll12Q3UDE2 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ttll12Q3UDE2 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ttll12Q3UDE2 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ttll12Q3UDE2 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ttll12Q3UDE2 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ttll12Q3UDE2 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ttll12Q3UDE2 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ttll12Q3UDE2 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ttll12Q3UDE2 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ttll12Q3UDE2 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ttll12Q3UDE2 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ttll12Q3UDE2 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ttll12Q3UDE2 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ttll12Q3UDE2 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ttll12Q3UDE2 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ttll12Q3UDE2 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ttll12Q3UDE2 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ttll12Q3UDE2 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ttll12Q3UDE2 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ttll12Q3UDE2 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ttll12Q3UDE2 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ttll12Q3UDE2 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ttll12Q3UDE2 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ttll12Q3UDE2 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ttll12Q3UDE2 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ttll12Q3UDE2 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ttll12Q3UDE2 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ttll12Q3UDE2 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ttll12Q3UDE2 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ttll12Q3UDE2 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ttll12Q3UDE2 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ttll12Q3UDE2 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ttll12Q3UDE2 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ttll12Q3UDE2 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ttll12Q3UDE2 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ttll12Q3UDE2 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ttll12Q3UDE2 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ttll12Q3UDE2 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ttll12Q3UDE2 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ttll12Q3UDE2 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ttll12Q3UDE2 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ttll12Q3UDE2 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ttll12Q3UDE2 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ttll12Q3UDE2 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ttll12Q3UDE2 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ttll12Q3UDE2 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ttll12Q3UDE2 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ttll12Q3UDE2 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ttll12Q3UDE2 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ttll12Q3UDE2 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ttll12Q3UDE2 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ttll12Q3UDE2 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms