Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q3U6N9 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Q3U6N9 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q3U6N9 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Q3U6N9 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Q3U6N9 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q3U6N9 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q3U6N9 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q3U6N9 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q3U6N9 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q3U6N9 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q3U6N9 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q3U6N9 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q3U6N9 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q3U6N9 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q3U6N9 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q3U6N9 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q3U6N9 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q3U6N9 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q3U6N9 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q3U6N9 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q3U6N9 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q3U6N9 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q3U6N9 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q3U6N9 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q3U6N9 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q3U6N9 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q3U6N9 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q3U6N9 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q3U6N9 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Q3U6N9 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q3U6N9 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q3U6N9 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q3U6N9 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q3U6N9 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q3U6N9 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q3U6N9 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q3U6N9 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q3U6N9 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q3U6N9 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q3U6N9 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q3U6N9 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q3U6N9 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q3U6N9 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q3U6N9 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q3U6N9 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q3U6N9 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q3U6N9 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Q3U6N9 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q3U6N9 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q3U6N9 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q3U6N9 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q3U6N9 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q3U6N9 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q3U6N9 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q3U6N9 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q3U6N9 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q3U6N9 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q3U6N9 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q3U6N9 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q3U6N9 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q3U6N9 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q3U6N9 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q3U6N9 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q3U6N9 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q3U6N9 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q3U6N9 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q3U6N9 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Q3U6N9 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q3U6N9 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q3U6N9 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q3U6N9 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Q3U6N9 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Q3U6N9 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Q3U6N9 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Q3U6N9 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Q3U6N9 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q3U6N9 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q3U6N9 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q3U6N9 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q3U6N9 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q3U6N9 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q3U6N9 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q3U6N9 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q3U6N9 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Q3U6N9 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q3U6N9 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q3U6N9 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q3U6N9 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q3U6N9 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q3U6N9 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q3U6N9 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3U6N9 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3U6N9 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3U6N9 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3U6N9 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3U6N9 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3U6N9 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3U6N9 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3U6N9 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms