Protein–RNA interactions for Protein: Q3U515

Vwce, von Willebrand factor C and EGF domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 929 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VwceQ3U515 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VwceQ3U515 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VwceQ3U515 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VwceQ3U515 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VwceQ3U515 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VwceQ3U515 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VwceQ3U515 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VwceQ3U515 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VwceQ3U515 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VwceQ3U515 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
VwceQ3U515 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VwceQ3U515 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VwceQ3U515 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
VwceQ3U515 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VwceQ3U515 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VwceQ3U515 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VwceQ3U515 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VwceQ3U515 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
VwceQ3U515 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VwceQ3U515 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
VwceQ3U515 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VwceQ3U515 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VwceQ3U515 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VwceQ3U515 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VwceQ3U515 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VwceQ3U515 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VwceQ3U515 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
VwceQ3U515 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VwceQ3U515 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VwceQ3U515 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VwceQ3U515 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VwceQ3U515 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VwceQ3U515 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
VwceQ3U515 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VwceQ3U515 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
VwceQ3U515 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VwceQ3U515 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VwceQ3U515 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VwceQ3U515 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VwceQ3U515 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VwceQ3U515 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VwceQ3U515 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VwceQ3U515 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VwceQ3U515 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VwceQ3U515 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VwceQ3U515 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VwceQ3U515 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VwceQ3U515 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VwceQ3U515 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VwceQ3U515 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VwceQ3U515 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VwceQ3U515 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VwceQ3U515 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VwceQ3U515 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VwceQ3U515 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VwceQ3U515 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16■□□□□ 0.15
VwceQ3U515 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC16■□□□□ 0.15
VwceQ3U515 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VwceQ3U515 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VwceQ3U515 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16■□□□□ 0.15
VwceQ3U515 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VwceQ3U515 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VwceQ3U515 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VwceQ3U515 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
VwceQ3U515 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VwceQ3U515 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VwceQ3U515 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VwceQ3U515 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VwceQ3U515 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VwceQ3U515 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
VwceQ3U515 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VwceQ3U515 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VwceQ3U515 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VwceQ3U515 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VwceQ3U515 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VwceQ3U515 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VwceQ3U515 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VwceQ3U515 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VwceQ3U515 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VwceQ3U515 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VwceQ3U515 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VwceQ3U515 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VwceQ3U515 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VwceQ3U515 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VwceQ3U515 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VwceQ3U515 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VwceQ3U515 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VwceQ3U515 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VwceQ3U515 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VwceQ3U515 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VwceQ3U515 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VwceQ3U515 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VwceQ3U515 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VwceQ3U515 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VwceQ3U515 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
VwceQ3U515 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VwceQ3U515 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
VwceQ3U515 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VwceQ3U515 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VwceQ3U515 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms