Protein–RNA interactions for Protein: Q3U285

Lcorl, Ligand-dependent nuclear receptor corepressor-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LcorlQ3U285 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
LcorlQ3U285 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LcorlQ3U285 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LcorlQ3U285 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LcorlQ3U285 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LcorlQ3U285 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LcorlQ3U285 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LcorlQ3U285 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LcorlQ3U285 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LcorlQ3U285 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LcorlQ3U285 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LcorlQ3U285 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LcorlQ3U285 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LcorlQ3U285 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LcorlQ3U285 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LcorlQ3U285 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LcorlQ3U285 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LcorlQ3U285 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LcorlQ3U285 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LcorlQ3U285 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LcorlQ3U285 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
LcorlQ3U285 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LcorlQ3U285 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LcorlQ3U285 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LcorlQ3U285 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LcorlQ3U285 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LcorlQ3U285 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LcorlQ3U285 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LcorlQ3U285 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LcorlQ3U285 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LcorlQ3U285 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LcorlQ3U285 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LcorlQ3U285 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LcorlQ3U285 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LcorlQ3U285 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LcorlQ3U285 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LcorlQ3U285 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LcorlQ3U285 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LcorlQ3U285 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LcorlQ3U285 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LcorlQ3U285 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LcorlQ3U285 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LcorlQ3U285 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LcorlQ3U285 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LcorlQ3U285 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LcorlQ3U285 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LcorlQ3U285 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LcorlQ3U285 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LcorlQ3U285 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LcorlQ3U285 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LcorlQ3U285 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LcorlQ3U285 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LcorlQ3U285 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LcorlQ3U285 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LcorlQ3U285 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LcorlQ3U285 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LcorlQ3U285 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LcorlQ3U285 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LcorlQ3U285 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LcorlQ3U285 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LcorlQ3U285 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LcorlQ3U285 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LcorlQ3U285 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LcorlQ3U285 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LcorlQ3U285 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LcorlQ3U285 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LcorlQ3U285 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LcorlQ3U285 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
LcorlQ3U285 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LcorlQ3U285 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LcorlQ3U285 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LcorlQ3U285 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LcorlQ3U285 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LcorlQ3U285 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LcorlQ3U285 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LcorlQ3U285 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LcorlQ3U285 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LcorlQ3U285 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LcorlQ3U285 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LcorlQ3U285 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LcorlQ3U285 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
LcorlQ3U285 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LcorlQ3U285 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LcorlQ3U285 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LcorlQ3U285 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LcorlQ3U285 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LcorlQ3U285 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LcorlQ3U285 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LcorlQ3U285 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LcorlQ3U285 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LcorlQ3U285 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LcorlQ3U285 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LcorlQ3U285 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LcorlQ3U285 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LcorlQ3U285 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LcorlQ3U285 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LcorlQ3U285 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LcorlQ3U285 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LcorlQ3U285 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LcorlQ3U285 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
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