Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1D9

UPF0602 protein C4orf47 homolog, mousemouse

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U1D9 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q3U1D9 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q3U1D9 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Q3U1D9 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q3U1D9 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Q3U1D9 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q3U1D9 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q3U1D9 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q3U1D9 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q3U1D9 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q3U1D9 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q3U1D9 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q3U1D9 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q3U1D9 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q3U1D9 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q3U1D9 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q3U1D9 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q3U1D9 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q3U1D9 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q3U1D9 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q3U1D9 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q3U1D9 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q3U1D9 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q3U1D9 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q3U1D9 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q3U1D9 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q3U1D9 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q3U1D9 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q3U1D9 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q3U1D9 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q3U1D9 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q3U1D9 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q3U1D9 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q3U1D9 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q3U1D9 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q3U1D9 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q3U1D9 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q3U1D9 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q3U1D9 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q3U1D9 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Q3U1D9 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q3U1D9 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q3U1D9 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q3U1D9 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Q3U1D9 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q3U1D9 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q3U1D9 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q3U1D9 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q3U1D9 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q3U1D9 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q3U1D9 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q3U1D9 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q3U1D9 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q3U1D9 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q3U1D9 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q3U1D9 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q3U1D9 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q3U1D9 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q3U1D9 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q3U1D9 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q3U1D9 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q3U1D9 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q3U1D9 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q3U1D9 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Q3U1D9 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q3U1D9 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Q3U1D9 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q3U1D9 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q3U1D9 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q3U1D9 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Q3U1D9 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q3U1D9 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q3U1D9 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q3U1D9 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q3U1D9 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q3U1D9 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q3U1D9 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q3U1D9 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q3U1D9 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q3U1D9 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q3U1D9 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q3U1D9 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q3U1D9 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q3U1D9 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Q3U1D9 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q3U1D9 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q3U1D9 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q3U1D9 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q3U1D9 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q3U1D9 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q3U1D9 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q3U1D9 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q3U1D9 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q3U1D9 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q3U1D9 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q3U1D9 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q3U1D9 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q3U1D9 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q3U1D9 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q3U1D9 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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