Protein–RNA interactions for Protein: Q3TR08

Fndc4, Fibronectin type III domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 231 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc4Q3TR08 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Fndc4Q3TR08 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Fndc4Q3TR08 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Fndc4Q3TR08 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Fndc4Q3TR08 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Fndc4Q3TR08 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Fndc4Q3TR08 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Fndc4Q3TR08 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Fndc4Q3TR08 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Fndc4Q3TR08 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Fndc4Q3TR08 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Fndc4Q3TR08 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Fndc4Q3TR08 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Fndc4Q3TR08 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Fndc4Q3TR08 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Fndc4Q3TR08 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Fndc4Q3TR08 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Fndc4Q3TR08 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Fndc4Q3TR08 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Fndc4Q3TR08 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Fndc4Q3TR08 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Fndc4Q3TR08 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Fndc4Q3TR08 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Fndc4Q3TR08 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Fndc4Q3TR08 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Fndc4Q3TR08 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Fndc4Q3TR08 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Fndc4Q3TR08 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Fndc4Q3TR08 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Fndc4Q3TR08 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Fndc4Q3TR08 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Fndc4Q3TR08 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Fndc4Q3TR08 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Fndc4Q3TR08 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Fndc4Q3TR08 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Fndc4Q3TR08 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Fndc4Q3TR08 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Fndc4Q3TR08 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Fndc4Q3TR08 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Fndc4Q3TR08 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Fndc4Q3TR08 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Fndc4Q3TR08 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Fndc4Q3TR08 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Fndc4Q3TR08 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Fndc4Q3TR08 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Fndc4Q3TR08 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Fndc4Q3TR08 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Fndc4Q3TR08 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Fndc4Q3TR08 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Fndc4Q3TR08 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Fndc4Q3TR08 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Fndc4Q3TR08 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Fndc4Q3TR08 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Fndc4Q3TR08 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Fndc4Q3TR08 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Fndc4Q3TR08 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Fndc4Q3TR08 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Fndc4Q3TR08 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Fndc4Q3TR08 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Fndc4Q3TR08 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Fndc4Q3TR08 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Fndc4Q3TR08 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Fndc4Q3TR08 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fndc4Q3TR08 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fndc4Q3TR08 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fndc4Q3TR08 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fndc4Q3TR08 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fndc4Q3TR08 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fndc4Q3TR08 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fndc4Q3TR08 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fndc4Q3TR08 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fndc4Q3TR08 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fndc4Q3TR08 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fndc4Q3TR08 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fndc4Q3TR08 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Fndc4Q3TR08 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fndc4Q3TR08 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fndc4Q3TR08 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Fndc4Q3TR08 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fndc4Q3TR08 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fndc4Q3TR08 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fndc4Q3TR08 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fndc4Q3TR08 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fndc4Q3TR08 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fndc4Q3TR08 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fndc4Q3TR08 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fndc4Q3TR08 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Fndc4Q3TR08 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Fndc4Q3TR08 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Fndc4Q3TR08 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Fndc4Q3TR08 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Fndc4Q3TR08 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Fndc4Q3TR08 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Fndc4Q3TR08 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Fndc4Q3TR08 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Fndc4Q3TR08 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Fndc4Q3TR08 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Fndc4Q3TR08 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Fndc4Q3TR08 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Fndc4Q3TR08 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
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