Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLI0

Trappc10, Trafficking protein particle complex subunit 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc10Q3TLI0 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trappc10Q3TLI0 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trappc10Q3TLI0 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trappc10Q3TLI0 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trappc10Q3TLI0 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trappc10Q3TLI0 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trappc10Q3TLI0 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trappc10Q3TLI0 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trappc10Q3TLI0 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trappc10Q3TLI0 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Trappc10Q3TLI0 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Trappc10Q3TLI0 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trappc10Q3TLI0 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trappc10Q3TLI0 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Trappc10Q3TLI0 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trappc10Q3TLI0 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Trappc10Q3TLI0 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trappc10Q3TLI0 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trappc10Q3TLI0 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trappc10Q3TLI0 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trappc10Q3TLI0 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trappc10Q3TLI0 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trappc10Q3TLI0 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trappc10Q3TLI0 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trappc10Q3TLI0 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trappc10Q3TLI0 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trappc10Q3TLI0 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trappc10Q3TLI0 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trappc10Q3TLI0 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Trappc10Q3TLI0 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trappc10Q3TLI0 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trappc10Q3TLI0 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trappc10Q3TLI0 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trappc10Q3TLI0 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trappc10Q3TLI0 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trappc10Q3TLI0 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trappc10Q3TLI0 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trappc10Q3TLI0 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trappc10Q3TLI0 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Trappc10Q3TLI0 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Trappc10Q3TLI0 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trappc10Q3TLI0 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trappc10Q3TLI0 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trappc10Q3TLI0 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trappc10Q3TLI0 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trappc10Q3TLI0 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trappc10Q3TLI0 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trappc10Q3TLI0 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trappc10Q3TLI0 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trappc10Q3TLI0 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trappc10Q3TLI0 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trappc10Q3TLI0 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trappc10Q3TLI0 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trappc10Q3TLI0 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trappc10Q3TLI0 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Trappc10Q3TLI0 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Trappc10Q3TLI0 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trappc10Q3TLI0 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trappc10Q3TLI0 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trappc10Q3TLI0 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trappc10Q3TLI0 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trappc10Q3TLI0 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trappc10Q3TLI0 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trappc10Q3TLI0 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trappc10Q3TLI0 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trappc10Q3TLI0 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trappc10Q3TLI0 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trappc10Q3TLI0 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trappc10Q3TLI0 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trappc10Q3TLI0 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trappc10Q3TLI0 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trappc10Q3TLI0 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trappc10Q3TLI0 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trappc10Q3TLI0 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trappc10Q3TLI0 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trappc10Q3TLI0 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trappc10Q3TLI0 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trappc10Q3TLI0 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trappc10Q3TLI0 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trappc10Q3TLI0 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trappc10Q3TLI0 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trappc10Q3TLI0 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trappc10Q3TLI0 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trappc10Q3TLI0 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trappc10Q3TLI0 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trappc10Q3TLI0 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trappc10Q3TLI0 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trappc10Q3TLI0 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trappc10Q3TLI0 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trappc10Q3TLI0 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Trappc10Q3TLI0 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trappc10Q3TLI0 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trappc10Q3TLI0 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trappc10Q3TLI0 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trappc10Q3TLI0 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trappc10Q3TLI0 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trappc10Q3TLI0 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trappc10Q3TLI0 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trappc10Q3TLI0 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trappc10Q3TLI0 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms