Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKT4

Smarca4, Transcription activator BRG1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca4Q3TKT4 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Smarca4Q3TKT4 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Smarca4Q3TKT4 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Smarca4Q3TKT4 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Smarca4Q3TKT4 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Smarca4Q3TKT4 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Smarca4Q3TKT4 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Smarca4Q3TKT4 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Smarca4Q3TKT4 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Smarca4Q3TKT4 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Smarca4Q3TKT4 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Smarca4Q3TKT4 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Smarca4Q3TKT4 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
Smarca4Q3TKT4 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Smarca4Q3TKT4 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Smarca4Q3TKT4 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
Smarca4Q3TKT4 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Smarca4Q3TKT4 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Smarca4Q3TKT4 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Smarca4Q3TKT4 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Smarca4Q3TKT4 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Smarca4Q3TKT4 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Smarca4Q3TKT4 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Smarca4Q3TKT4 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Smarca4Q3TKT4 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Smarca4Q3TKT4 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Smarca4Q3TKT4 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Smarca4Q3TKT4 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Smarca4Q3TKT4 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Smarca4Q3TKT4 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Smarca4Q3TKT4 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Smarca4Q3TKT4 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Smarca4Q3TKT4 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Smarca4Q3TKT4 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
Smarca4Q3TKT4 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Smarca4Q3TKT4 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Smarca4Q3TKT4 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Smarca4Q3TKT4 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Smarca4Q3TKT4 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Smarca4Q3TKT4 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Smarca4Q3TKT4 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Smarca4Q3TKT4 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Smarca4Q3TKT4 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Smarca4Q3TKT4 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Smarca4Q3TKT4 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
Smarca4Q3TKT4 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Smarca4Q3TKT4 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Smarca4Q3TKT4 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Smarca4Q3TKT4 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Smarca4Q3TKT4 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Smarca4Q3TKT4 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Smarca4Q3TKT4 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Smarca4Q3TKT4 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Smarca4Q3TKT4 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Smarca4Q3TKT4 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Smarca4Q3TKT4 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Smarca4Q3TKT4 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Smarca4Q3TKT4 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Smarca4Q3TKT4 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Smarca4Q3TKT4 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Smarca4Q3TKT4 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Smarca4Q3TKT4 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Smarca4Q3TKT4 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
Smarca4Q3TKT4 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Smarca4Q3TKT4 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Smarca4Q3TKT4 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Smarca4Q3TKT4 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Smarca4Q3TKT4 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Smarca4Q3TKT4 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Smarca4Q3TKT4 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Smarca4Q3TKT4 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Smarca4Q3TKT4 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
Smarca4Q3TKT4 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Smarca4Q3TKT4 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Smarca4Q3TKT4 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Smarca4Q3TKT4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Smarca4Q3TKT4 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Smarca4Q3TKT4 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Smarca4Q3TKT4 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Smarca4Q3TKT4 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
Smarca4Q3TKT4 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Smarca4Q3TKT4 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
Smarca4Q3TKT4 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
Smarca4Q3TKT4 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Smarca4Q3TKT4 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Smarca4Q3TKT4 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Smarca4Q3TKT4 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Smarca4Q3TKT4 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Smarca4Q3TKT4 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
Smarca4Q3TKT4 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Smarca4Q3TKT4 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Smarca4Q3TKT4 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Smarca4Q3TKT4 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Smarca4Q3TKT4 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Smarca4Q3TKT4 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Smarca4Q3TKT4 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Smarca4Q3TKT4 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Smarca4Q3TKT4 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Smarca4Q3TKT4 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Smarca4Q3TKT4 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95 ms