Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp39Q3TIX9 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp39Q3TIX9 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp39Q3TIX9 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp39Q3TIX9 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp39Q3TIX9 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp39Q3TIX9 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp39Q3TIX9 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp39Q3TIX9 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp39Q3TIX9 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp39Q3TIX9 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp39Q3TIX9 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp39Q3TIX9 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp39Q3TIX9 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp39Q3TIX9 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp39Q3TIX9 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp39Q3TIX9 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp39Q3TIX9 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp39Q3TIX9 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp39Q3TIX9 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp39Q3TIX9 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp39Q3TIX9 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp39Q3TIX9 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp39Q3TIX9 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp39Q3TIX9 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp39Q3TIX9 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp39Q3TIX9 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp39Q3TIX9 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp39Q3TIX9 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp39Q3TIX9 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp39Q3TIX9 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp39Q3TIX9 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp39Q3TIX9 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp39Q3TIX9 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp39Q3TIX9 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp39Q3TIX9 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp39Q3TIX9 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp39Q3TIX9 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp39Q3TIX9 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp39Q3TIX9 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp39Q3TIX9 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp39Q3TIX9 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp39Q3TIX9 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp39Q3TIX9 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp39Q3TIX9 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp39Q3TIX9 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp39Q3TIX9 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp39Q3TIX9 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp39Q3TIX9 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp39Q3TIX9 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp39Q3TIX9 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp39Q3TIX9 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp39Q3TIX9 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp39Q3TIX9 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp39Q3TIX9 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp39Q3TIX9 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp39Q3TIX9 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp39Q3TIX9 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp39Q3TIX9 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp39Q3TIX9 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp39Q3TIX9 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp39Q3TIX9 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp39Q3TIX9 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp39Q3TIX9 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp39Q3TIX9 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp39Q3TIX9 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp39Q3TIX9 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp39Q3TIX9 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp39Q3TIX9 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp39Q3TIX9 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp39Q3TIX9 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp39Q3TIX9 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp39Q3TIX9 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp39Q3TIX9 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp39Q3TIX9 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp39Q3TIX9 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp39Q3TIX9 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp39Q3TIX9 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Usp39Q3TIX9 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Usp39Q3TIX9 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Usp39Q3TIX9 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Usp39Q3TIX9 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Usp39Q3TIX9 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Usp39Q3TIX9 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp39Q3TIX9 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp39Q3TIX9 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp39Q3TIX9 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp39Q3TIX9 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp39Q3TIX9 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp39Q3TIX9 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp39Q3TIX9 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp39Q3TIX9 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp39Q3TIX9 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp39Q3TIX9 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp39Q3TIX9 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp39Q3TIX9 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp39Q3TIX9 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp39Q3TIX9 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp39Q3TIX9 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp39Q3TIX9 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.5 ms