Protein–RNA interactions for Protein: Q3TCJ8

Ccdc69, Coiled-coil domain-containing protein 69, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc69Q3TCJ8 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc69Q3TCJ8 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc69Q3TCJ8 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc69Q3TCJ8 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc69Q3TCJ8 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc69Q3TCJ8 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc69Q3TCJ8 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc69Q3TCJ8 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc69Q3TCJ8 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc69Q3TCJ8 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc69Q3TCJ8 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc69Q3TCJ8 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc69Q3TCJ8 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc69Q3TCJ8 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc69Q3TCJ8 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc69Q3TCJ8 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc69Q3TCJ8 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc69Q3TCJ8 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc69Q3TCJ8 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc69Q3TCJ8 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc69Q3TCJ8 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc69Q3TCJ8 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc69Q3TCJ8 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc69Q3TCJ8 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc69Q3TCJ8 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc69Q3TCJ8 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc69Q3TCJ8 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc69Q3TCJ8 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc69Q3TCJ8 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc69Q3TCJ8 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms