Protein–RNA interactions for Protein: Q3TBN1

Tmem248, Transmembrane protein 248, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem248Q3TBN1 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem248Q3TBN1 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem248Q3TBN1 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem248Q3TBN1 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem248Q3TBN1 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem248Q3TBN1 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem248Q3TBN1 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem248Q3TBN1 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem248Q3TBN1 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem248Q3TBN1 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem248Q3TBN1 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem248Q3TBN1 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem248Q3TBN1 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem248Q3TBN1 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem248Q3TBN1 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem248Q3TBN1 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem248Q3TBN1 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem248Q3TBN1 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem248Q3TBN1 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem248Q3TBN1 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem248Q3TBN1 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem248Q3TBN1 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem248Q3TBN1 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem248Q3TBN1 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem248Q3TBN1 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem248Q3TBN1 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem248Q3TBN1 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem248Q3TBN1 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem248Q3TBN1 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem248Q3TBN1 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem248Q3TBN1 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem248Q3TBN1 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem248Q3TBN1 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem248Q3TBN1 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem248Q3TBN1 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem248Q3TBN1 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem248Q3TBN1 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem248Q3TBN1 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem248Q3TBN1 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem248Q3TBN1 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem248Q3TBN1 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem248Q3TBN1 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem248Q3TBN1 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem248Q3TBN1 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem248Q3TBN1 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem248Q3TBN1 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem248Q3TBN1 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem248Q3TBN1 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem248Q3TBN1 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem248Q3TBN1 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem248Q3TBN1 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem248Q3TBN1 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem248Q3TBN1 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem248Q3TBN1 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem248Q3TBN1 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem248Q3TBN1 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem248Q3TBN1 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem248Q3TBN1 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem248Q3TBN1 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem248Q3TBN1 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem248Q3TBN1 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem248Q3TBN1 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem248Q3TBN1 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem248Q3TBN1 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem248Q3TBN1 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem248Q3TBN1 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem248Q3TBN1 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem248Q3TBN1 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem248Q3TBN1 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem248Q3TBN1 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem248Q3TBN1 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem248Q3TBN1 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem248Q3TBN1 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem248Q3TBN1 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem248Q3TBN1 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem248Q3TBN1 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem248Q3TBN1 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem248Q3TBN1 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem248Q3TBN1 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem248Q3TBN1 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem248Q3TBN1 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem248Q3TBN1 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem248Q3TBN1 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem248Q3TBN1 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem248Q3TBN1 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem248Q3TBN1 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem248Q3TBN1 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem248Q3TBN1 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem248Q3TBN1 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem248Q3TBN1 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem248Q3TBN1 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem248Q3TBN1 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem248Q3TBN1 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem248Q3TBN1 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem248Q3TBN1 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem248Q3TBN1 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem248Q3TBN1 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem248Q3TBN1 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem248Q3TBN1 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem248Q3TBN1 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms