Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNY5

Riiad1, RIIa domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riiad1Q3KNY5 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Riiad1Q3KNY5 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Riiad1Q3KNY5 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Riiad1Q3KNY5 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Riiad1Q3KNY5 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Riiad1Q3KNY5 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Riiad1Q3KNY5 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Riiad1Q3KNY5 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Riiad1Q3KNY5 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Riiad1Q3KNY5 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Riiad1Q3KNY5 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Riiad1Q3KNY5 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Riiad1Q3KNY5 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Riiad1Q3KNY5 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Riiad1Q3KNY5 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Riiad1Q3KNY5 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Riiad1Q3KNY5 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Riiad1Q3KNY5 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Riiad1Q3KNY5 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Riiad1Q3KNY5 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Riiad1Q3KNY5 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Riiad1Q3KNY5 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Riiad1Q3KNY5 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Riiad1Q3KNY5 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Riiad1Q3KNY5 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Riiad1Q3KNY5 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Riiad1Q3KNY5 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Riiad1Q3KNY5 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Riiad1Q3KNY5 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Riiad1Q3KNY5 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Riiad1Q3KNY5 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Riiad1Q3KNY5 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Riiad1Q3KNY5 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Riiad1Q3KNY5 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Riiad1Q3KNY5 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Riiad1Q3KNY5 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Riiad1Q3KNY5 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Riiad1Q3KNY5 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Riiad1Q3KNY5 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Riiad1Q3KNY5 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Riiad1Q3KNY5 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Riiad1Q3KNY5 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Riiad1Q3KNY5 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Riiad1Q3KNY5 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Riiad1Q3KNY5 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Riiad1Q3KNY5 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Riiad1Q3KNY5 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Riiad1Q3KNY5 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Riiad1Q3KNY5 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Riiad1Q3KNY5 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Riiad1Q3KNY5 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Riiad1Q3KNY5 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Riiad1Q3KNY5 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Riiad1Q3KNY5 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Riiad1Q3KNY5 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Riiad1Q3KNY5 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Riiad1Q3KNY5 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Riiad1Q3KNY5 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Riiad1Q3KNY5 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Riiad1Q3KNY5 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Riiad1Q3KNY5 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Riiad1Q3KNY5 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Riiad1Q3KNY5 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Riiad1Q3KNY5 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Riiad1Q3KNY5 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Riiad1Q3KNY5 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Riiad1Q3KNY5 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Riiad1Q3KNY5 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Riiad1Q3KNY5 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Riiad1Q3KNY5 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Riiad1Q3KNY5 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Riiad1Q3KNY5 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Riiad1Q3KNY5 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Riiad1Q3KNY5 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Riiad1Q3KNY5 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Riiad1Q3KNY5 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Riiad1Q3KNY5 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Riiad1Q3KNY5 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Riiad1Q3KNY5 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Riiad1Q3KNY5 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Riiad1Q3KNY5 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Riiad1Q3KNY5 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Riiad1Q3KNY5 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Riiad1Q3KNY5 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Riiad1Q3KNY5 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Riiad1Q3KNY5 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Riiad1Q3KNY5 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Riiad1Q3KNY5 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Riiad1Q3KNY5 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Riiad1Q3KNY5 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Riiad1Q3KNY5 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Riiad1Q3KNY5 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Riiad1Q3KNY5 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Riiad1Q3KNY5 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Riiad1Q3KNY5 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Riiad1Q3KNY5 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Riiad1Q3KNY5 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Riiad1Q3KNY5 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Riiad1Q3KNY5 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Riiad1Q3KNY5 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms