Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNL4

UPF0728 protein C10orf53 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3KNL4 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q3KNL4 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q3KNL4 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q3KNL4 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q3KNL4 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q3KNL4 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q3KNL4 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q3KNL4 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q3KNL4 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q3KNL4 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q3KNL4 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q3KNL4 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q3KNL4 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q3KNL4 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Q3KNL4 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q3KNL4 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Q3KNL4 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q3KNL4 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q3KNL4 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q3KNL4 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q3KNL4 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q3KNL4 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q3KNL4 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q3KNL4 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q3KNL4 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q3KNL4 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q3KNL4 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q3KNL4 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q3KNL4 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q3KNL4 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q3KNL4 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q3KNL4 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q3KNL4 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q3KNL4 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q3KNL4 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q3KNL4 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q3KNL4 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q3KNL4 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q3KNL4 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q3KNL4 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q3KNL4 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q3KNL4 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q3KNL4 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q3KNL4 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q3KNL4 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q3KNL4 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q3KNL4 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Q3KNL4 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q3KNL4 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q3KNL4 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q3KNL4 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q3KNL4 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q3KNL4 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q3KNL4 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q3KNL4 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q3KNL4 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q3KNL4 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q3KNL4 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Q3KNL4 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q3KNL4 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q3KNL4 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q3KNL4 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q3KNL4 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q3KNL4 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q3KNL4 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q3KNL4 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q3KNL4 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q3KNL4 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q3KNL4 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q3KNL4 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q3KNL4 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q3KNL4 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q3KNL4 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q3KNL4 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q3KNL4 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q3KNL4 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q3KNL4 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q3KNL4 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q3KNL4 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q3KNL4 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q3KNL4 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q3KNL4 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q3KNL4 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q3KNL4 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q3KNL4 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q3KNL4 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Q3KNL4 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q3KNL4 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q3KNL4 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q3KNL4 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q3KNL4 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q3KNL4 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q3KNL4 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q3KNL4 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q3KNL4 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q3KNL4 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q3KNL4 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q3KNL4 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q3KNL4 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q3KNL4 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms