Protein–RNA interactions for Protein: Q2TJ95

Rspo3, R-spondin-3, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rspo3Q2TJ95 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rspo3Q2TJ95 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rspo3Q2TJ95 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rspo3Q2TJ95 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rspo3Q2TJ95 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rspo3Q2TJ95 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rspo3Q2TJ95 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rspo3Q2TJ95 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rspo3Q2TJ95 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rspo3Q2TJ95 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rspo3Q2TJ95 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rspo3Q2TJ95 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rspo3Q2TJ95 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rspo3Q2TJ95 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rspo3Q2TJ95 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rspo3Q2TJ95 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rspo3Q2TJ95 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rspo3Q2TJ95 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rspo3Q2TJ95 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rspo3Q2TJ95 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rspo3Q2TJ95 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rspo3Q2TJ95 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rspo3Q2TJ95 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rspo3Q2TJ95 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rspo3Q2TJ95 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rspo3Q2TJ95 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rspo3Q2TJ95 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rspo3Q2TJ95 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rspo3Q2TJ95 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rspo3Q2TJ95 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rspo3Q2TJ95 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rspo3Q2TJ95 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rspo3Q2TJ95 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rspo3Q2TJ95 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rspo3Q2TJ95 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rspo3Q2TJ95 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rspo3Q2TJ95 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rspo3Q2TJ95 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rspo3Q2TJ95 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rspo3Q2TJ95 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rspo3Q2TJ95 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rspo3Q2TJ95 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rspo3Q2TJ95 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rspo3Q2TJ95 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rspo3Q2TJ95 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rspo3Q2TJ95 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rspo3Q2TJ95 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rspo3Q2TJ95 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rspo3Q2TJ95 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rspo3Q2TJ95 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rspo3Q2TJ95 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rspo3Q2TJ95 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rspo3Q2TJ95 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rspo3Q2TJ95 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rspo3Q2TJ95 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rspo3Q2TJ95 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rspo3Q2TJ95 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rspo3Q2TJ95 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rspo3Q2TJ95 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rspo3Q2TJ95 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rspo3Q2TJ95 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rspo3Q2TJ95 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rspo3Q2TJ95 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rspo3Q2TJ95 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rspo3Q2TJ95 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rspo3Q2TJ95 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rspo3Q2TJ95 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rspo3Q2TJ95 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rspo3Q2TJ95 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rspo3Q2TJ95 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rspo3Q2TJ95 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rspo3Q2TJ95 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rspo3Q2TJ95 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rspo3Q2TJ95 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rspo3Q2TJ95 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rspo3Q2TJ95 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rspo3Q2TJ95 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rspo3Q2TJ95 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rspo3Q2TJ95 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rspo3Q2TJ95 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rspo3Q2TJ95 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rspo3Q2TJ95 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rspo3Q2TJ95 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rspo3Q2TJ95 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rspo3Q2TJ95 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rspo3Q2TJ95 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rspo3Q2TJ95 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rspo3Q2TJ95 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rspo3Q2TJ95 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rspo3Q2TJ95 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rspo3Q2TJ95 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rspo3Q2TJ95 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rspo3Q2TJ95 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rspo3Q2TJ95 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rspo3Q2TJ95 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rspo3Q2TJ95 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rspo3Q2TJ95 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rspo3Q2TJ95 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rspo3Q2TJ95 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rspo3Q2TJ95 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms