Protein–RNA interactions for Protein: Q1A3B0

Cers3, Ceramide synthase 3, mousemouse

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Length 383 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cers3Q1A3B0 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cers3Q1A3B0 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cers3Q1A3B0 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cers3Q1A3B0 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cers3Q1A3B0 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cers3Q1A3B0 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cers3Q1A3B0 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cers3Q1A3B0 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cers3Q1A3B0 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cers3Q1A3B0 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cers3Q1A3B0 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cers3Q1A3B0 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cers3Q1A3B0 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cers3Q1A3B0 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cers3Q1A3B0 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cers3Q1A3B0 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cers3Q1A3B0 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cers3Q1A3B0 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cers3Q1A3B0 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cers3Q1A3B0 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cers3Q1A3B0 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cers3Q1A3B0 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cers3Q1A3B0 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cers3Q1A3B0 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Cers3Q1A3B0 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cers3Q1A3B0 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cers3Q1A3B0 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cers3Q1A3B0 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cers3Q1A3B0 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cers3Q1A3B0 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Cers3Q1A3B0 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Cers3Q1A3B0 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cers3Q1A3B0 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cers3Q1A3B0 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cers3Q1A3B0 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cers3Q1A3B0 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cers3Q1A3B0 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cers3Q1A3B0 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Cers3Q1A3B0 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Cers3Q1A3B0 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Cers3Q1A3B0 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cers3Q1A3B0 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Cers3Q1A3B0 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cers3Q1A3B0 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cers3Q1A3B0 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cers3Q1A3B0 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cers3Q1A3B0 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Cers3Q1A3B0 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Cers3Q1A3B0 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cers3Q1A3B0 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cers3Q1A3B0 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.31■■□□□ 1
Cers3Q1A3B0 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Cers3Q1A3B0 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.31■■□□□ 1
Cers3Q1A3B0 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cers3Q1A3B0 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cers3Q1A3B0 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cers3Q1A3B0 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cers3Q1A3B0 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cers3Q1A3B0 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cers3Q1A3B0 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cers3Q1A3B0 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cers3Q1A3B0 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cers3Q1A3B0 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cers3Q1A3B0 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cers3Q1A3B0 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cers3Q1A3B0 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cers3Q1A3B0 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cers3Q1A3B0 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cers3Q1A3B0 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cers3Q1A3B0 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cers3Q1A3B0 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cers3Q1A3B0 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cers3Q1A3B0 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cers3Q1A3B0 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cers3Q1A3B0 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cers3Q1A3B0 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cers3Q1A3B0 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cers3Q1A3B0 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cers3Q1A3B0 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cers3Q1A3B0 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cers3Q1A3B0 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cers3Q1A3B0 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cers3Q1A3B0 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Cers3Q1A3B0 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cers3Q1A3B0 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Cers3Q1A3B0 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Cers3Q1A3B0 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Cers3Q1A3B0 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cers3Q1A3B0 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cers3Q1A3B0 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cers3Q1A3B0 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cers3Q1A3B0 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cers3Q1A3B0 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cers3Q1A3B0 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cers3Q1A3B0 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cers3Q1A3B0 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Cers3Q1A3B0 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cers3Q1A3B0 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cers3Q1A3B0 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cers3Q1A3B0 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
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