Protein–RNA interactions for Protein: Q14C51

Ptcd3, Pentatricopeptide repeat domain-containing protein 3, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 685 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptcd3Q14C51 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptcd3Q14C51 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptcd3Q14C51 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptcd3Q14C51 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptcd3Q14C51 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptcd3Q14C51 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptcd3Q14C51 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptcd3Q14C51 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptcd3Q14C51 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptcd3Q14C51 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptcd3Q14C51 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptcd3Q14C51 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptcd3Q14C51 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptcd3Q14C51 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptcd3Q14C51 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptcd3Q14C51 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptcd3Q14C51 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptcd3Q14C51 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptcd3Q14C51 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptcd3Q14C51 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptcd3Q14C51 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptcd3Q14C51 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptcd3Q14C51 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptcd3Q14C51 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptcd3Q14C51 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptcd3Q14C51 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptcd3Q14C51 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptcd3Q14C51 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptcd3Q14C51 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptcd3Q14C51 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptcd3Q14C51 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptcd3Q14C51 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptcd3Q14C51 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptcd3Q14C51 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptcd3Q14C51 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ptcd3Q14C51 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ptcd3Q14C51 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ptcd3Q14C51 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ptcd3Q14C51 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ptcd3Q14C51 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ptcd3Q14C51 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ptcd3Q14C51 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ptcd3Q14C51 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ptcd3Q14C51 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ptcd3Q14C51 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ptcd3Q14C51 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ptcd3Q14C51 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ptcd3Q14C51 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ptcd3Q14C51 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ptcd3Q14C51 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ptcd3Q14C51 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ptcd3Q14C51 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ptcd3Q14C51 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ptcd3Q14C51 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ptcd3Q14C51 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ptcd3Q14C51 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ptcd3Q14C51 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ptcd3Q14C51 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ptcd3Q14C51 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ptcd3Q14C51 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ptcd3Q14C51 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ptcd3Q14C51 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ptcd3Q14C51 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ptcd3Q14C51 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ptcd3Q14C51 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ptcd3Q14C51 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ptcd3Q14C51 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ptcd3Q14C51 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ptcd3Q14C51 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ptcd3Q14C51 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ptcd3Q14C51 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ptcd3Q14C51 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ptcd3Q14C51 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ptcd3Q14C51 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ptcd3Q14C51 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ptcd3Q14C51 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ptcd3Q14C51 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ptcd3Q14C51 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ptcd3Q14C51 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ptcd3Q14C51 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ptcd3Q14C51 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ptcd3Q14C51 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ptcd3Q14C51 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ptcd3Q14C51 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ptcd3Q14C51 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ptcd3Q14C51 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ptcd3Q14C51 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ptcd3Q14C51 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ptcd3Q14C51 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ptcd3Q14C51 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ptcd3Q14C51 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ptcd3Q14C51 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ptcd3Q14C51 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ptcd3Q14C51 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ptcd3Q14C51 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ptcd3Q14C51 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ptcd3Q14C51 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ptcd3Q14C51 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ptcd3Q14C51 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ptcd3Q14C51 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
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