Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpusd3Q14AI6 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpusd3Q14AI6 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpusd3Q14AI6 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpusd3Q14AI6 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpusd3Q14AI6 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rpusd3Q14AI6 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rpusd3Q14AI6 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rpusd3Q14AI6 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rpusd3Q14AI6 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rpusd3Q14AI6 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rpusd3Q14AI6 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Rpusd3Q14AI6 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rpusd3Q14AI6 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rpusd3Q14AI6 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Rpusd3Q14AI6 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rpusd3Q14AI6 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rpusd3Q14AI6 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rpusd3Q14AI6 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rpusd3Q14AI6 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rpusd3Q14AI6 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rpusd3Q14AI6 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rpusd3Q14AI6 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rpusd3Q14AI6 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rpusd3Q14AI6 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rpusd3Q14AI6 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rpusd3Q14AI6 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rpusd3Q14AI6 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rpusd3Q14AI6 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rpusd3Q14AI6 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Rpusd3Q14AI6 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rpusd3Q14AI6 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rpusd3Q14AI6 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rpusd3Q14AI6 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Rpusd3Q14AI6 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Rpusd3Q14AI6 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rpusd3Q14AI6 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rpusd3Q14AI6 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rpusd3Q14AI6 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rpusd3Q14AI6 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rpusd3Q14AI6 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rpusd3Q14AI6 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rpusd3Q14AI6 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rpusd3Q14AI6 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rpusd3Q14AI6 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rpusd3Q14AI6 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rpusd3Q14AI6 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
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Rpusd3Q14AI6 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rpusd3Q14AI6 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rpusd3Q14AI6 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rpusd3Q14AI6 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rpusd3Q14AI6 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Rpusd3Q14AI6 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Rpusd3Q14AI6 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rpusd3Q14AI6 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rpusd3Q14AI6 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rpusd3Q14AI6 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rpusd3Q14AI6 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rpusd3Q14AI6 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpusd3Q14AI6 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpusd3Q14AI6 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpusd3Q14AI6 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpusd3Q14AI6 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpusd3Q14AI6 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpusd3Q14AI6 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpusd3Q14AI6 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpusd3Q14AI6 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpusd3Q14AI6 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpusd3Q14AI6 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpusd3Q14AI6 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpusd3Q14AI6 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpusd3Q14AI6 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpusd3Q14AI6 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpusd3Q14AI6 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
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Rpusd3Q14AI6 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpusd3Q14AI6 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpusd3Q14AI6 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpusd3Q14AI6 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpusd3Q14AI6 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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