Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGT2

Gli2, Zinc finger protein GLI2, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli2Q0VGT2 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gli2Q0VGT2 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gli2Q0VGT2 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gli2Q0VGT2 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gli2Q0VGT2 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gli2Q0VGT2 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gli2Q0VGT2 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gli2Q0VGT2 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gli2Q0VGT2 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gli2Q0VGT2 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gli2Q0VGT2 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gli2Q0VGT2 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gli2Q0VGT2 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gli2Q0VGT2 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gli2Q0VGT2 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gli2Q0VGT2 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gli2Q0VGT2 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gli2Q0VGT2 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gli2Q0VGT2 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gli2Q0VGT2 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gli2Q0VGT2 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Gli2Q0VGT2 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gli2Q0VGT2 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gli2Q0VGT2 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gli2Q0VGT2 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gli2Q0VGT2 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gli2Q0VGT2 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Gli2Q0VGT2 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gli2Q0VGT2 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gli2Q0VGT2 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gli2Q0VGT2 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gli2Q0VGT2 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gli2Q0VGT2 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gli2Q0VGT2 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gli2Q0VGT2 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gli2Q0VGT2 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gli2Q0VGT2 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gli2Q0VGT2 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gli2Q0VGT2 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gli2Q0VGT2 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gli2Q0VGT2 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gli2Q0VGT2 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gli2Q0VGT2 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gli2Q0VGT2 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gli2Q0VGT2 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gli2Q0VGT2 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gli2Q0VGT2 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gli2Q0VGT2 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gli2Q0VGT2 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gli2Q0VGT2 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gli2Q0VGT2 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gli2Q0VGT2 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Gli2Q0VGT2 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gli2Q0VGT2 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gli2Q0VGT2 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gli2Q0VGT2 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gli2Q0VGT2 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gli2Q0VGT2 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gli2Q0VGT2 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gli2Q0VGT2 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gli2Q0VGT2 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Gli2Q0VGT2 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gli2Q0VGT2 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gli2Q0VGT2 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gli2Q0VGT2 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gli2Q0VGT2 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gli2Q0VGT2 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gli2Q0VGT2 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gli2Q0VGT2 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gli2Q0VGT2 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gli2Q0VGT2 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gli2Q0VGT2 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gli2Q0VGT2 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gli2Q0VGT2 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Gli2Q0VGT2 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gli2Q0VGT2 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gli2Q0VGT2 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gli2Q0VGT2 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gli2Q0VGT2 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gli2Q0VGT2 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gli2Q0VGT2 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gli2Q0VGT2 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gli2Q0VGT2 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Gli2Q0VGT2 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Gli2Q0VGT2 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Gli2Q0VGT2 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gli2Q0VGT2 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gli2Q0VGT2 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gli2Q0VGT2 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Gli2Q0VGT2 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gli2Q0VGT2 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gli2Q0VGT2 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gli2Q0VGT2 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gli2Q0VGT2 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gli2Q0VGT2 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gli2Q0VGT2 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gli2Q0VGT2 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gli2Q0VGT2 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gli2Q0VGT2 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Gli2Q0VGT2 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms