Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc162pQ0VG85 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc162pQ0VG85 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc162pQ0VG85 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc162pQ0VG85 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc162pQ0VG85 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc162pQ0VG85 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc162pQ0VG85 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc162pQ0VG85 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc162pQ0VG85 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc162pQ0VG85 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc162pQ0VG85 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc162pQ0VG85 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc162pQ0VG85 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc162pQ0VG85 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc162pQ0VG85 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc162pQ0VG85 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc162pQ0VG85 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc162pQ0VG85 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc162pQ0VG85 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc162pQ0VG85 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc162pQ0VG85 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc162pQ0VG85 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc162pQ0VG85 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc162pQ0VG85 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc162pQ0VG85 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc162pQ0VG85 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc162pQ0VG85 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc162pQ0VG85 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc162pQ0VG85 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc162pQ0VG85 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc162pQ0VG85 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc162pQ0VG85 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc162pQ0VG85 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc162pQ0VG85 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc162pQ0VG85 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc162pQ0VG85 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc162pQ0VG85 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc162pQ0VG85 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc162pQ0VG85 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc162pQ0VG85 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc162pQ0VG85 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc162pQ0VG85 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc162pQ0VG85 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc162pQ0VG85 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc162pQ0VG85 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc162pQ0VG85 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc162pQ0VG85 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc162pQ0VG85 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc162pQ0VG85 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc162pQ0VG85 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc162pQ0VG85 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc162pQ0VG85 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc162pQ0VG85 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc162pQ0VG85 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc162pQ0VG85 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc162pQ0VG85 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc162pQ0VG85 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc162pQ0VG85 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc162pQ0VG85 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc162pQ0VG85 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc162pQ0VG85 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc162pQ0VG85 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc162pQ0VG85 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc162pQ0VG85 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc162pQ0VG85 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc162pQ0VG85 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc162pQ0VG85 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc162pQ0VG85 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc162pQ0VG85 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc162pQ0VG85 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc162pQ0VG85 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc162pQ0VG85 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc162pQ0VG85 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc162pQ0VG85 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc162pQ0VG85 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc162pQ0VG85 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc162pQ0VG85 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc162pQ0VG85 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc162pQ0VG85 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc162pQ0VG85 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc162pQ0VG85 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc162pQ0VG85 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc162pQ0VG85 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc162pQ0VG85 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc162pQ0VG85 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc162pQ0VG85 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc162pQ0VG85 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc162pQ0VG85 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc162pQ0VG85 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc162pQ0VG85 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc162pQ0VG85 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc162pQ0VG85 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc162pQ0VG85 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc162pQ0VG85 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc162pQ0VG85 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc162pQ0VG85 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc162pQ0VG85 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc162pQ0VG85 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc162pQ0VG85 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms