Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Atp2b3Q0VF55 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Atp2b3Q0VF55 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Atp2b3Q0VF55 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Atp2b3Q0VF55 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Atp2b3Q0VF55 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Atp2b3Q0VF55 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Atp2b3Q0VF55 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Atp2b3Q0VF55 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Atp2b3Q0VF55 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Atp2b3Q0VF55 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Atp2b3Q0VF55 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Atp2b3Q0VF55 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Atp2b3Q0VF55 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Atp2b3Q0VF55 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Atp2b3Q0VF55 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Atp2b3Q0VF55 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Atp2b3Q0VF55 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Atp2b3Q0VF55 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Atp2b3Q0VF55 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Atp2b3Q0VF55 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Atp2b3Q0VF55 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Atp2b3Q0VF55 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Atp2b3Q0VF55 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Atp2b3Q0VF55 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Atp2b3Q0VF55 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Atp2b3Q0VF55 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Atp2b3Q0VF55 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Atp2b3Q0VF55 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Atp2b3Q0VF55 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Atp2b3Q0VF55 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Atp2b3Q0VF55 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Atp2b3Q0VF55 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Atp2b3Q0VF55 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Atp2b3Q0VF55 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Atp2b3Q0VF55 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Atp2b3Q0VF55 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Atp2b3Q0VF55 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Atp2b3Q0VF55 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Atp2b3Q0VF55 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Atp2b3Q0VF55 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Atp2b3Q0VF55 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Atp2b3Q0VF55 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Atp2b3Q0VF55 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Atp2b3Q0VF55 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Atp2b3Q0VF55 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Atp2b3Q0VF55 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Atp2b3Q0VF55 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Atp2b3Q0VF55 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Atp2b3Q0VF55 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Atp2b3Q0VF55 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Atp2b3Q0VF55 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Atp2b3Q0VF55 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Atp2b3Q0VF55 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Atp2b3Q0VF55 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Atp2b3Q0VF55 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Atp2b3Q0VF55 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Atp2b3Q0VF55 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Atp2b3Q0VF55 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Atp2b3Q0VF55 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Atp2b3Q0VF55 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Atp2b3Q0VF55 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Atp2b3Q0VF55 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Atp2b3Q0VF55 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Atp2b3Q0VF55 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Atp2b3Q0VF55 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Atp2b3Q0VF55 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Atp2b3Q0VF55 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Atp2b3Q0VF55 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Atp2b3Q0VF55 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Atp2b3Q0VF55 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Atp2b3Q0VF55 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Atp2b3Q0VF55 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Atp2b3Q0VF55 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Atp2b3Q0VF55 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Atp2b3Q0VF55 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Atp2b3Q0VF55 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Atp2b3Q0VF55 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Atp2b3Q0VF55 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Atp2b3Q0VF55 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Atp2b3Q0VF55 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Atp2b3Q0VF55 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Atp2b3Q0VF55 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Atp2b3Q0VF55 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Atp2b3Q0VF55 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Atp2b3Q0VF55 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Atp2b3Q0VF55 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Atp2b3Q0VF55 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Atp2b3Q0VF55 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Atp2b3Q0VF55 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Atp2b3Q0VF55 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Atp2b3Q0VF55 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Atp2b3Q0VF55 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Atp2b3Q0VF55 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Atp2b3Q0VF55 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Atp2b3Q0VF55 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Atp2b3Q0VF55 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Atp2b3Q0VF55 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Atp2b3Q0VF55 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Atp2b3Q0VF55 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms