Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE82

Cpne7, Copine-7, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne7Q0VE82 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cpne7Q0VE82 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cpne7Q0VE82 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cpne7Q0VE82 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cpne7Q0VE82 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cpne7Q0VE82 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cpne7Q0VE82 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Cpne7Q0VE82 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Cpne7Q0VE82 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cpne7Q0VE82 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cpne7Q0VE82 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cpne7Q0VE82 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cpne7Q0VE82 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cpne7Q0VE82 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cpne7Q0VE82 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cpne7Q0VE82 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cpne7Q0VE82 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cpne7Q0VE82 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cpne7Q0VE82 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cpne7Q0VE82 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cpne7Q0VE82 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cpne7Q0VE82 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cpne7Q0VE82 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cpne7Q0VE82 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cpne7Q0VE82 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cpne7Q0VE82 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cpne7Q0VE82 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cpne7Q0VE82 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cpne7Q0VE82 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cpne7Q0VE82 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cpne7Q0VE82 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cpne7Q0VE82 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cpne7Q0VE82 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cpne7Q0VE82 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cpne7Q0VE82 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cpne7Q0VE82 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cpne7Q0VE82 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cpne7Q0VE82 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cpne7Q0VE82 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cpne7Q0VE82 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cpne7Q0VE82 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cpne7Q0VE82 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cpne7Q0VE82 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cpne7Q0VE82 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cpne7Q0VE82 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cpne7Q0VE82 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cpne7Q0VE82 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Cpne7Q0VE82 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cpne7Q0VE82 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Cpne7Q0VE82 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Cpne7Q0VE82 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cpne7Q0VE82 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cpne7Q0VE82 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cpne7Q0VE82 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cpne7Q0VE82 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cpne7Q0VE82 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cpne7Q0VE82 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Cpne7Q0VE82 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cpne7Q0VE82 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cpne7Q0VE82 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cpne7Q0VE82 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cpne7Q0VE82 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cpne7Q0VE82 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cpne7Q0VE82 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cpne7Q0VE82 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cpne7Q0VE82 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cpne7Q0VE82 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cpne7Q0VE82 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Cpne7Q0VE82 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cpne7Q0VE82 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Cpne7Q0VE82 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cpne7Q0VE82 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cpne7Q0VE82 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cpne7Q0VE82 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cpne7Q0VE82 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cpne7Q0VE82 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Cpne7Q0VE82 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cpne7Q0VE82 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cpne7Q0VE82 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cpne7Q0VE82 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cpne7Q0VE82 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cpne7Q0VE82 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cpne7Q0VE82 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cpne7Q0VE82 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cpne7Q0VE82 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cpne7Q0VE82 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cpne7Q0VE82 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Cpne7Q0VE82 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cpne7Q0VE82 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Cpne7Q0VE82 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cpne7Q0VE82 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cpne7Q0VE82 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cpne7Q0VE82 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cpne7Q0VE82 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cpne7Q0VE82 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cpne7Q0VE82 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cpne7Q0VE82 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cpne7Q0VE82 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cpne7Q0VE82 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Cpne7Q0VE82 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms