Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rundc1Q0VDN7 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rundc1Q0VDN7 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rundc1Q0VDN7 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rundc1Q0VDN7 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rundc1Q0VDN7 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rundc1Q0VDN7 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rundc1Q0VDN7 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Rundc1Q0VDN7 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rundc1Q0VDN7 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rundc1Q0VDN7 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rundc1Q0VDN7 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rundc1Q0VDN7 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rundc1Q0VDN7 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rundc1Q0VDN7 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rundc1Q0VDN7 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rundc1Q0VDN7 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rundc1Q0VDN7 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Rundc1Q0VDN7 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rundc1Q0VDN7 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rundc1Q0VDN7 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rundc1Q0VDN7 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rundc1Q0VDN7 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rundc1Q0VDN7 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rundc1Q0VDN7 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rundc1Q0VDN7 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rundc1Q0VDN7 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rundc1Q0VDN7 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Rundc1Q0VDN7 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rundc1Q0VDN7 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Rundc1Q0VDN7 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rundc1Q0VDN7 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rundc1Q0VDN7 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rundc1Q0VDN7 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rundc1Q0VDN7 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rundc1Q0VDN7 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rundc1Q0VDN7 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rundc1Q0VDN7 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rundc1Q0VDN7 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rundc1Q0VDN7 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rundc1Q0VDN7 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rundc1Q0VDN7 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rundc1Q0VDN7 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rundc1Q0VDN7 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rundc1Q0VDN7 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Rundc1Q0VDN7 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rundc1Q0VDN7 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rundc1Q0VDN7 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rundc1Q0VDN7 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rundc1Q0VDN7 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rundc1Q0VDN7 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rundc1Q0VDN7 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rundc1Q0VDN7 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rundc1Q0VDN7 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rundc1Q0VDN7 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rundc1Q0VDN7 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rundc1Q0VDN7 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rundc1Q0VDN7 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Rundc1Q0VDN7 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rundc1Q0VDN7 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rundc1Q0VDN7 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rundc1Q0VDN7 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rundc1Q0VDN7 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rundc1Q0VDN7 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rundc1Q0VDN7 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rundc1Q0VDN7 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rundc1Q0VDN7 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rundc1Q0VDN7 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rundc1Q0VDN7 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rundc1Q0VDN7 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rundc1Q0VDN7 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rundc1Q0VDN7 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rundc1Q0VDN7 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rundc1Q0VDN7 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rundc1Q0VDN7 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rundc1Q0VDN7 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rundc1Q0VDN7 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rundc1Q0VDN7 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rundc1Q0VDN7 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Rundc1Q0VDN7 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rundc1Q0VDN7 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rundc1Q0VDN7 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rundc1Q0VDN7 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rundc1Q0VDN7 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rundc1Q0VDN7 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rundc1Q0VDN7 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rundc1Q0VDN7 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rundc1Q0VDN7 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rundc1Q0VDN7 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rundc1Q0VDN7 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rundc1Q0VDN7 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Rundc1Q0VDN7 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rundc1Q0VDN7 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rundc1Q0VDN7 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rundc1Q0VDN7 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rundc1Q0VDN7 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rundc1Q0VDN7 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rundc1Q0VDN7 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rundc1Q0VDN7 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rundc1Q0VDN7 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms