Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBF8

Stum, Protein stum homolog, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StumQ0VBF8 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
StumQ0VBF8 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
StumQ0VBF8 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
StumQ0VBF8 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
StumQ0VBF8 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
StumQ0VBF8 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
StumQ0VBF8 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
StumQ0VBF8 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
StumQ0VBF8 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
StumQ0VBF8 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
StumQ0VBF8 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
StumQ0VBF8 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
StumQ0VBF8 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
StumQ0VBF8 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
StumQ0VBF8 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
StumQ0VBF8 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
StumQ0VBF8 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
StumQ0VBF8 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
StumQ0VBF8 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
StumQ0VBF8 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
StumQ0VBF8 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
StumQ0VBF8 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
StumQ0VBF8 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
StumQ0VBF8 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
StumQ0VBF8 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
StumQ0VBF8 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
StumQ0VBF8 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
StumQ0VBF8 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
StumQ0VBF8 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
StumQ0VBF8 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
StumQ0VBF8 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
StumQ0VBF8 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
StumQ0VBF8 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
StumQ0VBF8 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
StumQ0VBF8 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
StumQ0VBF8 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
StumQ0VBF8 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
StumQ0VBF8 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
StumQ0VBF8 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
StumQ0VBF8 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
StumQ0VBF8 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
StumQ0VBF8 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
StumQ0VBF8 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
StumQ0VBF8 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
StumQ0VBF8 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
StumQ0VBF8 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
StumQ0VBF8 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
StumQ0VBF8 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
StumQ0VBF8 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
StumQ0VBF8 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
StumQ0VBF8 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
StumQ0VBF8 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
StumQ0VBF8 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
StumQ0VBF8 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
StumQ0VBF8 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
StumQ0VBF8 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
StumQ0VBF8 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
StumQ0VBF8 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
StumQ0VBF8 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
StumQ0VBF8 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
StumQ0VBF8 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
StumQ0VBF8 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
StumQ0VBF8 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
StumQ0VBF8 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
StumQ0VBF8 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
StumQ0VBF8 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
StumQ0VBF8 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
StumQ0VBF8 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
StumQ0VBF8 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
StumQ0VBF8 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
StumQ0VBF8 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
StumQ0VBF8 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
StumQ0VBF8 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
StumQ0VBF8 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
StumQ0VBF8 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
StumQ0VBF8 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
StumQ0VBF8 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
StumQ0VBF8 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
StumQ0VBF8 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
StumQ0VBF8 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
StumQ0VBF8 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
StumQ0VBF8 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
StumQ0VBF8 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
StumQ0VBF8 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
StumQ0VBF8 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
StumQ0VBF8 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
StumQ0VBF8 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
StumQ0VBF8 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
StumQ0VBF8 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
StumQ0VBF8 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
StumQ0VBF8 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
StumQ0VBF8 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
StumQ0VBF8 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
StumQ0VBF8 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
StumQ0VBF8 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
StumQ0VBF8 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
StumQ0VBF8 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
StumQ0VBF8 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
StumQ0VBF8 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
StumQ0VBF8 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms