Protein–RNA interactions for Protein: Q0P557

Spata18, Mitochondria-eating protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spata18Q0P557 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Spata18Q0P557 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Spata18Q0P557 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Spata18Q0P557 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Spata18Q0P557 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Spata18Q0P557 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Spata18Q0P557 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Spata18Q0P557 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Spata18Q0P557 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Spata18Q0P557 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Spata18Q0P557 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Spata18Q0P557 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Spata18Q0P557 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Spata18Q0P557 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Spata18Q0P557 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Spata18Q0P557 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Spata18Q0P557 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Spata18Q0P557 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Spata18Q0P557 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Spata18Q0P557 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Spata18Q0P557 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Spata18Q0P557 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Spata18Q0P557 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Spata18Q0P557 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Spata18Q0P557 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Spata18Q0P557 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Spata18Q0P557 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Spata18Q0P557 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Spata18Q0P557 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Spata18Q0P557 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Spata18Q0P557 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Spata18Q0P557 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Spata18Q0P557 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Spata18Q0P557 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Spata18Q0P557 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Spata18Q0P557 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Spata18Q0P557 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Spata18Q0P557 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Spata18Q0P557 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Spata18Q0P557 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Spata18Q0P557 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Spata18Q0P557 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Spata18Q0P557 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Spata18Q0P557 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Spata18Q0P557 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Spata18Q0P557 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Spata18Q0P557 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Spata18Q0P557 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Spata18Q0P557 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Spata18Q0P557 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Spata18Q0P557 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Spata18Q0P557 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Spata18Q0P557 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Spata18Q0P557 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Spata18Q0P557 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Spata18Q0P557 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Spata18Q0P557 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Spata18Q0P557 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Spata18Q0P557 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Spata18Q0P557 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Spata18Q0P557 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Spata18Q0P557 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Spata18Q0P557 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Spata18Q0P557 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Spata18Q0P557 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Spata18Q0P557 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Spata18Q0P557 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Spata18Q0P557 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Spata18Q0P557 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Spata18Q0P557 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Spata18Q0P557 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Spata18Q0P557 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Spata18Q0P557 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Spata18Q0P557 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Spata18Q0P557 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Spata18Q0P557 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Spata18Q0P557 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Spata18Q0P557 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Spata18Q0P557 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Spata18Q0P557 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Spata18Q0P557 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Spata18Q0P557 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Spata18Q0P557 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Spata18Q0P557 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Spata18Q0P557 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Spata18Q0P557 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Spata18Q0P557 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Spata18Q0P557 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Spata18Q0P557 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Spata18Q0P557 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Spata18Q0P557 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Spata18Q0P557 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Spata18Q0P557 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Spata18Q0P557 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Spata18Q0P557 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Spata18Q0P557 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Spata18Q0P557 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Spata18Q0P557 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Spata18Q0P557 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Spata18Q0P557 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms