Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ubxn2bQ0KL01 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ubxn2bQ0KL01 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ubxn2bQ0KL01 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ubxn2bQ0KL01 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ubxn2bQ0KL01 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ubxn2bQ0KL01 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ubxn2bQ0KL01 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ubxn2bQ0KL01 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ubxn2bQ0KL01 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Ubxn2bQ0KL01 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ubxn2bQ0KL01 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ubxn2bQ0KL01 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ubxn2bQ0KL01 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ubxn2bQ0KL01 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ubxn2bQ0KL01 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ubxn2bQ0KL01 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ubxn2bQ0KL01 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ubxn2bQ0KL01 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ubxn2bQ0KL01 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ubxn2bQ0KL01 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ubxn2bQ0KL01 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ubxn2bQ0KL01 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Ubxn2bQ0KL01 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Ubxn2bQ0KL01 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ubxn2bQ0KL01 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ubxn2bQ0KL01 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ubxn2bQ0KL01 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ubxn2bQ0KL01 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ubxn2bQ0KL01 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ubxn2bQ0KL01 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ubxn2bQ0KL01 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ubxn2bQ0KL01 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ubxn2bQ0KL01 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ubxn2bQ0KL01 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ubxn2bQ0KL01 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ubxn2bQ0KL01 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ubxn2bQ0KL01 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ubxn2bQ0KL01 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ubxn2bQ0KL01 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Ubxn2bQ0KL01 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ubxn2bQ0KL01 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ubxn2bQ0KL01 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ubxn2bQ0KL01 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ubxn2bQ0KL01 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ubxn2bQ0KL01 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ubxn2bQ0KL01 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ubxn2bQ0KL01 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ubxn2bQ0KL01 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ubxn2bQ0KL01 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Ubxn2bQ0KL01 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ubxn2bQ0KL01 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ubxn2bQ0KL01 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ubxn2bQ0KL01 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ubxn2bQ0KL01 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ubxn2bQ0KL01 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ubxn2bQ0KL01 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ubxn2bQ0KL01 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ubxn2bQ0KL01 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ubxn2bQ0KL01 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ubxn2bQ0KL01 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ubxn2bQ0KL01 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ubxn2bQ0KL01 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ubxn2bQ0KL01 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ubxn2bQ0KL01 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Ubxn2bQ0KL01 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ubxn2bQ0KL01 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ubxn2bQ0KL01 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ubxn2bQ0KL01 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ubxn2bQ0KL01 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Ubxn2bQ0KL01 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ubxn2bQ0KL01 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ubxn2bQ0KL01 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ubxn2bQ0KL01 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Ubxn2bQ0KL01 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ubxn2bQ0KL01 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ubxn2bQ0KL01 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ubxn2bQ0KL01 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ubxn2bQ0KL01 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ubxn2bQ0KL01 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ubxn2bQ0KL01 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ubxn2bQ0KL01 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ubxn2bQ0KL01 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ubxn2bQ0KL01 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ubxn2bQ0KL01 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Ubxn2bQ0KL01 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Ubxn2bQ0KL01 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Ubxn2bQ0KL01 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ubxn2bQ0KL01 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ubxn2bQ0KL01 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ubxn2bQ0KL01 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ubxn2bQ0KL01 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ubxn2bQ0KL01 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ubxn2bQ0KL01 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ubxn2bQ0KL01 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ubxn2bQ0KL01 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ubxn2bQ0KL01 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ubxn2bQ0KL01 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ubxn2bQ0KL01 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ubxn2bQ0KL01 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms